单细胞测序数据挖掘与课题设计

单细胞测序数据挖掘与课题设计

近年来,单细胞测序研究空前火热,重磅研究成果频出,越来越多的科研工作者开始使用单细胞测序这一基因表达研究利器。单细胞测序是从单个细胞水平对基因组和转录组进行的研究。通过全基因组或转录组扩增,进行高通量测序,能够揭示单个细胞的基因结构和基因表达状态,反映细胞间的异质性。 相比于群体细胞测序,更适用于解决少量特殊样本的研究、异质性群体的分析及同时或互斥发生的基因组变化的查找等问题。单细胞测序技术在肿瘤、发育生物学、微生物学、神经科学等领域有重要应用,是现今生命科学研究的焦点。

一、目标:
1、了解单细胞测序基本概念及原理
2、了解单细胞测序分析的数据分析及研究思路
3、学会R语言基本语法和绘图技巧,并用R代码进行单细胞转录组分析
4、掌握和利用单细胞测序技术进行具体工作的开展等
二、主讲专家:
高级生物信息工程师,长期从事分子生物学专业研究,擅长生物信息数据分析,包括基因组组装,变异检测分析,单细胞测序,宏基因测序,精通linux系统,R语言,python语言等。
三、时间地点:
2021年11月04日—2021年11月07日
(第一天报到, 授课三天)

四、课程体系
理论讲解及实战(上机实践)
一、单细胞测序技术与应用 1. 单细胞组学技术发展历程和原理介绍。
2. 单细胞测序技术在科研领域的应用。
3. 近年单细胞技术CNS文章思路解析。
4. 单细胞文章常见图表解读。
5. 单细胞组学技术在癌症、发育、免疫及在植物等领域的研究内容及思路。
二、Linux及R语言入门与实操 1. 常规基础Linux命令入门讲解及实操训练。
2. R语言简介及安装,RStudio的安装及使用说明。<

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