单细胞测序分析及单细胞转录组

单细胞测序技术的应用与数据分析、单细胞转录组为主题，精心设计了具有前沿性、实用性和针对性强的理论课程和上机课程。培训邀请的主讲人均是有理论和实际研究经验的人员。学员通过与专家直接交流，能够分享到这些顶尖学术机构的研究经验和实验设计思路。学员通过集中专题学习后能够扩展思路，在研究技术方面领悟更多。

2019年8月16日——8月19日 山东青岛

单细胞测序技术与应用 1. 单细胞组学技术发展历程和原理介绍。
2. 单细胞测序技术在科研领域的应用。
3. 近年单细胞方向高分文章思路解析。
4. 单细胞组学和多组学整合分析思路和案例介绍。

Linux及R语言入门与实操 1. 常规基础Linux命令入门讲解及实操训练。
5. R语言简介及安装，RStudio的安装及使用说明。
6. R语言语法介绍及常用命令。
7. 数据处理功能及统计应用。
8. R语言画图实操。

单细胞转录组数据分析思路及流程
1. 单细胞实验处理、建库及测序。
9. 单细胞转录组比对、定量、分群及拟时间分析等分析思路。
10. 单细胞转录组转录因子及功能通路解析。
11. 单细胞组学技术在癌症、发育、免疫及在植物、微生物等领域的研究内容及思路。

单细胞转录组数据分析实操
1. 常规单细胞组学数据比对。
12. 10X官方单细胞软件Cellranger讲解及实操。
13. 从基因表达矩阵开始到marker基因筛选全过程讲解及实操。
14. 通过Seurat软件进行PCA及tSNE降维。
15. 单细胞转录组细胞鉴定及聚类分析。
16. 通过Seurat及GSVA等进行单细胞转录组差异分析。
多组学整合分析和结果解读 1. 转录组，基因组，表观分析介绍。
17. RNA和 ATAC-seq等多组学整合分析。
18. 常规10X单细胞ATAC数据测序原理简介、分析流程介绍。
19. 单细胞免疫组库测序技术及应用。
20. 组学分析常用数据库介绍及使用。

单细胞转录组轨迹、通路、转录因子等分析及绘图实操
1. 通过Monocle软件进行单细胞转录组拟时间分析。
21. 通过DAVID及metascape网站进行通路富集分析。
22. 通过SCENIC软件进行转录因子预测分析。
23. tSNE，小提琴图，热图，网络图，GO、KEGG富集图，GSEA等图形绘制。

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