HPA数据库的使用(1)

HPA(HumanProteinAtlas)是一个详细的人类蛋白质资源,提供RRM2基因在不同组织和病理条件下的表达信息。用户可以查看RRM2在正常肺组织和肺癌病理情况下的免疫组化结果,揭示其在疾病进程中的作用。

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HPA(Human Protein Atlas)人类蛋白质图谱数据库是一个全面的人类蛋白质信息资源,旨在提供对人类基因和蛋白质表达模式的详尽描述。该数据库整合了多种组织和细胞类型的蛋白质组学数据,包括免疫组织化学、免疫组化和高通量抗体制备技术等。

1、打开网址:https://www.proteinatlas.org/

2 、查找RRM2基因表达情况

3、点开RRM2条目:

Tissue:组织图谱;Brain:脑图谱;Single cell type:单细胞类型图谱;Tissue cell:组织细胞图谱;Pathology:病理图谱;Disease:疾病图谱;immune:免疫图谱;Blood:血液图谱;Subcell:亚细胞图谱;Cell line:细胞系图谱;Structure:结构图谱;Interaction:相互作用图谱。

 4、点击TISSUE(正常组织图谱)

 可以查看在具体组织的表达情况:查看在肺癌中的表达情况

 可以查看到RRM2基因在正常肺组织中的免疫组化结果

 5、点击PATHOLOGY进入病理组织图谱

 选择lung cancer

 有免疫组化蛋白的表达情况

 

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