PyMOL开源版的安装教程

安装开源的PyMOL (open-source)

PyMOL是一款用于蛋白质结构可视化，可进行蛋白互作分析、蛋白与分子对接、及药物设计等。以下是开源PyMOL软件的安装流程。如果对你有帮助的话麻烦点个关注加收藏啊，谢谢！！！

1. PyMOL的使用依赖的Python环境

安装PyMOL之前必须安装python，另外需要注意PyMOL的开源版本必须同python保持抑制，否则无法正常使用PyMOL。我是用的是python 3.12 Download Python | Python.orgThe official home of the Python Programming Languagehttps://www.python.org/downloads/记住python下载安装的路径，我这里是C:\Users\cxf\AppData

2 .numpy、pmw、pyqt5 文件下载

按住Window+R输入cmd

python -m pip install numpy
python -m pip install pmw
python -m pip install pyqt5

输入上述代码，下载三个文件

3 从以下链接下载预编译的开源 PyMOL wheel 文件，兼容 Python 3.12 和 Windows 64 位：

https://github.com/cnpem/PyMOL4Win/releases/latest/download/pymol_launcher-2.6-cp312-cp312-win_amd64.whlhttps://github.com/cnpem/PyMOL4Win/releases/latest/download/pymol_launcher-2.6-cp312-cp312-win_amd64.whlhttps://github.com/cnpem/PyMOL4Win/releases/latest/download/pymol-2.6.0a0-cp312-cp312-win_amd64.whlhttps://github.com/cnpem/PyMOL4Win/releases/latest/download/pymol-2.6.0a0-cp312-cp312-win_amd64.whlhttps://github.com/cnpem/PyMOL4Win/releases/latest/download/pymol_launcher-2.6-cp312-cp312-win_amd64.whlhttps://github.com/cnpem/PyMOL4Win/releases/latest/download/pymol_launcher-2.6-cp312-cp312-win_amd64.whl

4. 在 cmd 窗口（不是 PowerShell！），切换到下载目录（C:\Users\cxf\AppData）：

cd /d C:\Users\cxf\AppData

5. 下载匹配的文件 pymol_launcher-2.6-cp312-cp312-win_amd64.whl:

python -m pip install --no-index --find-links="%CD%" pymol_launcher-2.6-cp312-cp312-win_amd64.whl

6. 最后下载 pymol-2.6.0a0-cp312-cp312-win_amd64.whl:

python -m pip install --upgrade --no-deps pymol-2.6.0a0-cp312-cp312-win_amd64.whl

7. 在CMD  (not PowerShell!)运行:

where.exe pymol
pymol

8.  PyMOL v2.6 安装好，打开PyMOL.

where.exe pymol

9. 最后pymol.exe即可在安装位置看到. 方便使用可以复制粘贴在桌面上。

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