载入工作路径:
安装limma包(这里用BiocManager安装的):
读取表达矩阵和分组信息:
表达矩阵行为基因,列为样本。
构建分组矩阵和比较矩阵:
线性拟合,会得到一个DEG文件,里面有logFC、P.Value值以及adj.P.Val值:
根据标准进行筛选 :
绘制火山图:
载入工作路径:
安装limma包(这里用BiocManager安装的):
读取表达矩阵和分组信息:
表达矩阵行为基因,列为样本。
构建分组矩阵和比较矩阵:
线性拟合,会得到一个DEG文件,里面有logFC、P.Value值以及adj.P.Val值:
根据标准进行筛选 :
绘制火山图: