enumerate structures

最新推荐文章于 2023-10-20 23:33:34 发布

没有感情的敲代码机器

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处理部分占据的另一个方法：

https://matgenb.materialsvirtuallab.org/2013/01/01/Ordering-Disordered-Structures.html

Using the EnumerateStructureTransformation：

首先需要安装enumlib，教程：

https://github.com/msg-byu/enumlib/blob/master/README.md

在COMPILING THE CODE部分，因为我的是windows系统，在黑匣子里面输入代码后，找不到enum.x文件，后来就在虚拟机里面安装了，Linux和OSX系统安装方便些。因为之前我的虚拟机没有安装conda，python，后来都重新安装了，安装过程的报错基本都可以百度得到解决方法。

from pymatgen.transformations.advanced_transformations import EnumerateStructureTransformation
specie = {"Cu": 0.5, "Au": 0.5}
cuau = Structure.from_spacegroup("Fm-3m", Lattice.cubic(3.677), [specie], [[0, 0, 0]])

trans = EnumerateStructureTransformation(max_cell_size=3) #这里max_cell_size=3跟在前面建个3x1x1的超胞效果一样
ss = trans.apply_transformation(cuau, return_ranked_list=1000)