空间肿瘤学:将环境生物学转化为临床与肿瘤成纤维细胞的划分

作者，Evil Genius

按照这个趋势，看来是遇不到好女孩了，有没有一起打光棍的？

今日参考文献

知识积累

• 通过单细胞谱鉴定的高级分子生物标志物的兴起增加了我们对癌症细胞异质性的理解，但尚未显著影响临床护理。
• 空间技术将分子分析与微环境特征相结合，为理解细胞相互作用和组织提供了关键的原位环境

空间数据分析的计算方法

细胞分割方法：CellPose和StarDist

肿瘤微环境中靶向治疗的细胞相互作用

• 肿瘤异质性是影响肿瘤治疗效果的一个重要障碍。
• TMEs中的多细胞相互作用下面的例子说明了空间转录组学在临床前研究中的应用，以确定TME中相关的细胞相互作用，并进一步研究治疗靶向性.
  
   

多细胞生态系统的邻域分析

• 邻域分析是一种用于表征空间定义微环境的细胞组成的方法，可用于研究细胞的空间组织如何导致与疾病进展相关的紧急特性。
• 细胞niche和组织结构的高分辨率分子信息有助于更好地识别靶向机制。
• 邻域分析还可以识别肿瘤组织的特定有丝分裂区和浸润区。

配体-受体相互作用介导肿瘤进展和治疗耐药性的推断

• 配体-受体相互作用在促进癌细胞存活、增殖的多细胞通讯中起着至关重要的作用，逃避免疫和治疗诱导的细胞死亡。
• 在一些临床前和临床模型中观察到配体受体相互作用介导的治疗耐药。
• 为了加强配体受体相互作用分析，稀疏空间数据集通常与更高灵敏度的scRNA-seq数据集相结合，以绘制空间中的单细胞图谱。

肿瘤-基质界面肿瘤相关成纤维细胞的治疗靶点

纤维细胞的划分，参考文献

CAFs在肿瘤微环境中的空间分布

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