R中Error in gzfile(file, mode) : cannot open the connection“Permission denied”

前言：在R中rds文件进行保存。其中integrated为通过R处理过后的单细胞整合数据，将其保存在“integrated.s4.sct.rds”中。

执行后发现报错如下：

显示连接失败，无法打开此文件，可能原因是无权限。

解决办法：

1. 首先尝试创建该文件，并想到自身账号在保存目录下是否拥有写入权限；
2. 然后发现saveRDS属于base包中，尝试导入base包；
3. 查阅资料后发现，可能需要加上绝对路径。

成功解决。

saveRDS(integrated,"/data1/Jiangss_/seuratdata/integrated.s4.sct.rds")

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通过pdf()产生一个pdf文件，报错：显示无法打开该文件。

问题原因：

此时的data1文件所属者（A）不是我现在使用的用户（B），因此B无权限对A所属文件进行写入操作。

 解决办法：

1. （法一）由于我用的mobaxterm软件，可以在左边的界面用鼠标直接右键进行创建。
2. （法二）改写权限。通过root用户执行以下命令：

   sudo chown -R B$name:B$password data1
   

   对该文件更改权限。

顺利解决。