1. 使用conda进行安装:conda install fastp
2,使用wget进行安装:wget http://opengene.org/fastp/fastp
我使用了第一种:
使用fastp 软件进行质控,chmod a+x fastp使其可运用./fastp;可使用系统默认质控参数。
质控完成后显示数据。
,使用批量质控的方法:vim .sh创建文件夹 ,i-编辑; 将质控命令复制进去,修改所在文件夹,我数据在不同文件夹需要自己修改。 esc,shift+:,wq保存退出,sh fastp .sh即可。