赛题介绍
本次比赛旨在利用机器学习技术,预测化学修饰后的siRNA序列在RNA干扰(RNAi)机制下对靶基因的沉默效率。RNAi是一种重要的基因表达调控机制,通过干扰特定基因的表达,可以用于疾病治疗。这次比赛的目标是通过构建并优化模型,准确预测siRNA的沉默效率,从而提升药物设计的效率和效果。
背景解析
1.RNAi(RNA干扰)是一种手段,让siRNA与靶RNA结合,诱导RISC切割mRNA。
2.化学修饰siRNA,在siRNA中加入化学修饰,增强靶向性、稳定性、有效性,常见修饰包括磷酸酯骨架、核苷酸末端。
3.目标是选择合适的siRNA序列、修饰后的siRNA序列、靶mRNA序列以及实验条件。
4.模型训练通过优化调整模型参数,常用的指标有均分误差(MSE)、平均绝对误差(MAE)、精确率和召回率(Recall)。