ImageJ 用户手册——第五部分（菜单命令Image）

菜单命令

28. Image

28.1 Type

使用此子菜单可以确定活动图像的类型或将其转换为其他类型。尝试执行不支持的转换时，会显示一个对话框，列出可能的转换。

• 8–bit：转换为8位灰度。ImageJ通过从最小值-最大值到0–255的线性缩放将16位和32位图像转换为8位，其中最小值和最大值是Image>Adjust>Brightness/Contrast中显示的两个值。Image>Show Info将这两个值显示为“显示范围”。请注意，如果在Edit>Options>Conversions中未选中“转换时缩放”，则不会执行此缩放。如果在Edit>Options>Conversions 中选中了“加权RGB转换”，则RGB图像将使用公式gray=（红色+绿色+蓝色）/3转换为灰度，或gray=0.299×红色+0.587×绿色+0.114×蓝色。
• 16–bit：转换为无符号的16位灰度。
• 32–bit：转换为带符号的32位浮点灰度。
• 8–bit Color：使用Heckbert的中值剪切颜色量化算法转换为8位索引颜色。一个对话框允许指定颜色的数量（2–256）。活动图像必须是RGB颜色。
• RGB Color：转换为32位RGB颜色。
• RGB Stack：转换为3片（红色、绿色、蓝色）堆栈。活动图像必须是RGB颜色。
• HSB Stack：转换为3片（色调、饱和度和亮度）堆栈。活动图像必须是RGB颜色。

28.2 Adjust

此子菜单包含调整亮度/对比度、阈值级别和图像大小的命令。

28.2.1 Brightness/Contrast

使用此工具可以交互更改活动图像的亮度和对比度。对于8位图像，通过更新图像的查找表（LUT）来改变亮度和对比度，因此像素值不变。对于16位和32位图像，通过将映射从像素值更改为8位显示值来更新显示，因此像素像素值也保持不变。通过修改像素值来改变RGB图像的亮度和对比度。

• Histogram：窗口顶部的折线图位于图像的直方图上，显示了像素值如何映射到8位（0-255）的显示值。绘图下方的两个数字是显示的最小和最大像素值。这两个值定义了显示范围或“窗口”。ImageJ通过将显示范围内的像素值线性映射到0–255范围内的显示值来显示图像。值小于最小值的像素显示为黑色，而值大于最大值的像素则显示为白色。
• Minimum and Maximum sliders：控制显示范围的下限和上限。按住Shift键将同时调整合成图像的所有通道。
• Brightness slider：通过移动显示范围来增加或降低图像亮度。按住Shift键将同时调整合成图像的所有通道。
• Contrast slider：通过改变显示范围的宽度来增加或减少对比度。显示范围越窄，对比度就越高。按住Shift键将同时调整合成图像的所有通道。
• Auto：ImageJ将基于对图像直方图的分析自动优化亮度和对比度。创建一个选区，整个图像将根据对选区的分析进行优化。通过允许图像中的一小部分像素饱和（显示为黑色或白色）来进行优化。每次额外单击“自动”都会增加饱和像素的数量，从而增加优化量。如果命令记录器（Plugin>macro>Record…）正在运行，则会生成run（“Enhance Contrast”, “saturated=0.35”）宏调用。
• Reset：恢复原始亮度和对比度设置。显示范围被设置为图像的全像素值范围。如果命令记录器正在运行，则会生成resetMinAndMax（）宏调用。按住Shift键可恢复合成图像的所有通道中的原始设置。
• Set：允许在对话框中输入最小和最大显示范围值。如果命令记录器正在运行，则会生成setMinAndMax（）宏调用。16位图像由65536个可能的灰度级组成。然而，大多数情况下，相关图像信息仅包含在灰度的窄范围内。例如，在微光显微镜中就是这种情况，其中信号被限制在灰度的下端。设置显示范围对话框允许您选择如何缩放16位图像的灰度级范围。
  - Automatic：根据从最低像素值到最高像素值的像素值总数的百分比，自动选择给定图像强度值的最佳范围。
  - 8–bit (0–255)：灰度级范围为0–255。
  - 10–bit (0–1023)：灰度级范围为0–1023。
  - 12–bit (0–4095)：灰度级范围为0–4095。
  - 15–bit (0–32767)：灰度级范围为0–32767。
  - 16–bit (0-65535)：灰度级范围为0–65535。
  选中“传播到所有打开的图像”，将这些值应用到当前打开的其余图像。对于多通道图像，还可以选择将指定范围传播到其余通道。
• Apply：将当前显示范围映射功能应用于像素数据。如果有选区，则仅修改选区中的像素。该选项目前仅适用于8位图像、8位堆栈和RGB堆栈。这是唯一一个改变非RGB图像像素数据的B&C选项。

28.2.2 Window/Level

该命令和亮度/对比度[C]（B&C）是多余的，但窗口/级别（W&L）的行为方式更接近于在医学图像终端上实现的方式，通过交互调整窗口-最小和最大范围（对比度）-以及级别-灰度强度空间中该范围的位置（亮度）。如果B&C窗口打开，它将关闭，W&L窗口将在同一位置打开。

28.2.3 Color Balance

此面板可调整标准RGB图像的单一颜色的亮度和对比度（每个颜色通道8位）。对于多通道堆栈和Hyperstacks（彩色合成图像），它会相应地调整每个颜色通道。使用下拉菜单指定要调整的颜色/通道（为所选通道绘制直方图）。

Image>Adjust>Brightness/Contrast中所述的“最大”和“最小”滑块、“自动”、“设置”和“应用”工作。与“窗口/级别”工具类似，如果打开B&C窗口，它将被关闭，并且“颜色”窗口将在同一位置打开。从一种颜色切换到另一种颜色时，除非之前单击“应用”，否则对一种颜色所做的更改将丢失。此外，请注意，对于作为堆栈加载的48位彩色图像，亮度/对比度适用于单个堆栈切片，即颜色，并且忽略“颜色”面板的颜色设置。

28.2.4 Threshold

使用此工具可以自动或交互设置阈值下限和上限，将灰度图像分割为感兴趣的特征和背景。使用Analyze>Measure[m]（选中Analyze>Set Measurements中的限制阈值）来测量所选特征的总和。

• Upper slider：调整最小阈值。按住Shift键，同时调整最小值，以在灰度值范围内移动固定宽度的阈值窗口。
• Lower slider：调整最大阈值。
• Method：允许选择16种不同的自动阈值方法中的任何一种。Fiji的Auto Threshold网站上介绍了这些方法。默认方法是ImageJ 1.41及更早版本使用的修改后的IsoData算法。请注意，这些是全局阈值化方法，通常无法处理照明不均匀的图像。在这些情况下，通过允许阈值在图像上平滑变化，局部算法更为合适。这些都是通过在Fiji预装的Auto Local Threshold插件实现的。
• Display：选择三种显示模式之一：
  - Red：以红色显示阈值。
  - B&W：特征以黑色显示，背景以白色显示。此模式尊重Process>Binary>Options中设置的黑色背景标志。
  - Over/Under：以蓝色显示低于下限阈值的像素，以灰度显示阈值像素，以绿色显示高于上限阈值的像素。这些颜色可以通过从宏中调用ImageProces 的sor.setOverColor（）和setUnderColor（）方法更改‌。
• Dark background：当特征比背景亮时进行检查。复选框的状态会在重新启动时被记住。
• Stack histogram：如果选中，ImageJ将首先计算整个堆栈（或超堆栈）的直方图，然后根据该直方图计算阈值。因此，使用单个计算值对所有切片进行二值化。如果未选中，则会单独计算每个切片的阈值。
• Auto：使用当前选择的阈值方法，根据对当前图像或选择的直方图的分析自动设置阈值级别。
• Apply：将阈值像素设置为黑色，将所有其他像素设置为白色。对于32位浮点图像，Apply还将运行Process>Math>NaN Background。
• Reset：禁用阈值设置并更新直方图。
• Set：可以在此对话框中输入新的阈值级别。

28.2.5 Color Threshold

基于色调饱和度和亮度（HSB）、红-绿-蓝（RGB）、CIE Lab或YUV分量的24位RGB图像阈值。滤波器的范围可以手动设置，也可以基于用户定义的ROI的像素值分量进行设置。该命令在1.43l版本中实现，是Threshold Colour插件的实验内置版本，尚未完全集成到ImageJ中。

• Pass：如果选中，则对范围内的值进行阈值处理并显示（带通滤波器），否则，对选定范围外的值进行阀值处理（带阻滤波器）。
• Thresholding Method：允许选择16种不同的自动阈值方法中的任何一种。
• Threshold Color：选择阈值颜色：Red, Black, White or Black & White
• Color space：选择颜色空间：HSB、RGB、CIE Lab或YUV
• Dark background：当特征比背景亮时进行检查。复选框的状态会在重新启动时被记住。
• Original：恢复原始图像，并在切换到另一个图像时更新缓冲区。
• Filtered：显示过滤后的图像。请注意，最终的阈值图像类型是RGB，而不是8位灰度。
• Select：根据当前设置创建ROI选择。根据Process>Binary>Options对话框中定义的设置进行选择。
• Sample：（实验）基于用户定义ROI中的像素值分量设置滤波器的范围。
• Stack：使用当前设置处理堆栈的剩余切片（如果有）。
• Macro：根据当前设置创建一个宏，该设置发送到“宏录制器”窗口（Plugins>Macros>Record）（如果打开）。
• Help：打开内置的帮助对话框。

28.2.6 Size

将活动图像或选区缩放到以像素为单位的指定宽度和高度。选中“约束纵横比”，ImageJ将调整“高度”或“宽度”以保持原始纵横比。如果适用，也可以调整其他维度的大小：堆栈中的深度（图像）、超堆栈中的“深度”（切片）和“时间”（帧）。选中缩小图像时的平均值复选框，以在缩小图像时获得更好的结果。两种重新采样方法是可能的：双线性插值和双三次插值。

28.2.7 Canvas Size

在不缩放实际图像的情况下更改画布大小。宽度和高度可以是展开的，也可以是收缩的。如果画布大小增加，则使用当前背景色填充边框，或者，如果选中“零填充”，则使用值为零的像素填充边框。还可以指定旧图像在新画布内的位置。

28.2.8 Line Width

此小部件用于调整行选择的宽度（以像素为单位）。双击“线选择工具”图标可以更容易地打开它。检查样条线拟合将三次样条线曲线拟合到定义直线的点。

28.3 Show Info

打开包含活动图像信息的文本窗口。对于DICOM和FITS图像，还显示文件头信息。使用弹出菜单（右键单击“信息”窗口）将信息保存到文本文件或复制到系统剪贴板。

28.4 Properties

使用此命令可以显示和设置当前图像或堆栈的各种属性。只要c、z和t的乘积等于堆栈中的图像数量，就可以更改图像中的通道（c）、切片（z）和帧（t）的数量。长度单位是一个字符串，用于描述像素宽度、像素高度和体素深度的测量单位。如果长度单位从ImageJ的一个已知单位（“m”、“µm”[或“um”或“微米”]、“mm”、“cm”、“米”、“km”或“英寸”）更改为另一个单位，则会自动转换这三个维度。µ和Å