Ubuntu机器安装rdkit指定版本，通过conda安装不需要make，有手就行。

阿里云购买Ubuntu 22.0机器

IP没错，访问外网没问题

图片中的命令放在下面了。

useradd test-user -s /bin/bash
mkdir /home/test-user
chown -R test-user: /home/test-user
passwd test-user

vi /etc/sudoers   




wget -c 'https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-2023.09-0-Linux-x86_64.sh'
sudo ln -s /home/test-user/anaconda3/bin/conda /bin/conda    
conda config --set auto_activate_base false
conda create -n rdkit-env python=3.11.9
source anaconda3/bin/activate rdkit-env
conda search rdkit   
vi ~/.condarc

#######################################################################################
channels:
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/pytorch/    
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/        
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/msys2/      
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge 
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/        
  - defaults
show_channel_urls: true
default_channels:
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/r
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/msys2        
custom_channels:
  conda-forge: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud  
  msys2: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud        
  bioconda: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud     
  menpo: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud        
  pytorch: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud      
  pytorch-lts: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud  
  simpleitk: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud    
  deepmodeling: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/


#######################################################################################


conda install -c conda-forge rdkit=2020.9.1
conda remove python
conda install python=3.7.6
conda install -c conda-forge rdkit=2020.9.1

python
import rdkit
from rdkit import Chem
print(rdkit.__version__)

创建普通用户用作安装rdkit

修改/etc/sudoers

切换普通用户下载安装Anaconda

开始安装，出现间断之后

第一次回车

第二次yes   （阅读安装协议的时候可以使用空格翻页）

第三次回车

第四次yes

创建软连接

创建虚拟环境rdkit-env，指定Python版本为3.11.9

进入虚拟环境

没有找到rdkit包、使用的默认源

更换conda源为清华源，修改~/.condarc

再次查询找到了包，找到我们指定的版本安装即可

安装报错,提示版本兼容

更换Python3.7.6版本尝试

卸载现有Python

安装Python3.7.6

再次进行rdkit安装

安装成功、测试正常。存在个疑点，安装完毕后Python版本变成了3.7.12  疑似是安装rdkit时有强依赖关联升级。