华西生物医学大数据中心俞鹏课题组博士后招聘启事

四川大学华西医院生物医学大数据中心俞鹏课题组拟招收博士后数名。主要从事：1）生物信息学及实验验证，2）生物医学信息学，3）生物医学文献审编和本体构建，4）药用植物基因组学及合成生物学，5）化学信息学。课题组经费充足。

一、导师介绍

俞鹏，四川大学华西医院生物医学大数据中心特聘研究员，国家级青年人才项目获得者。博士毕业于美国德州大学奥斯汀分校，先后在贝勒医学院、德州农机大学开展生物医学信息学的研究，主要包括转录组学、选择性剪接、高通量生物数据分析、数据审编、文本挖掘和本体构建等方面。在本领域权威期刊如Proc Natl Acad Sci USA、Bioinformatics 、Nucleic Acids Res 等上发表论文四十余篇，单篇最高Google学术引用307次，论文Google学术总引用1700余次。曾多次受邀于国内外高校、会议等做研究报告。其研究获得了多家机构的支持，多次担任CCF推荐B类会议ISMB和BIBM的技术程序委员会委员， 曾参与NIH 基金评审，还担任学术期刊Scientific Reports 、PLoS ONE、BMC Bioinformatics副主编，并多次为学术期刊审稿。（更多详情，请点击原文链接，跳转导师介绍）

二、招聘详情

1、 基本要求

（1）具有国内外大学或研究机构的生物信息学、医学信息学、计算机科学、统计学、生物化学、分子生物学、遗传学、细胞生物学、微生物学、病理学和药学等相关学科博士学位。

（2）能独立和/或协助课题组负责人开展相关科研工作，有良好的团队协作精神。

（3）良好的中、英文阅读、写作、翻译及表达能力；认真负责，具团队精神；能协助指导研究生科研工作。

（4）在相关领域发表过具有影响力的、SCI收录的专业期刊的第一作者或通讯作者论文。

2、具体方向及要求

(1) 生物信息学及实验验证

针对能量代谢疾病，如肥胖症等疾病及冷刺激诱导代谢过程，运用基因组、转录组、表征遗传组、单细胞测序及宏基因组等大数据，综合分子、细胞、遗传等生物学实验方法，研究基因调控过程和发病机理。

应聘者满足a或b任意一项即可。

a. 计算：

i. 具有生物信息学或计算机类相关专业博士学历，具有长期测序数据的分析经验。

ii. 熟悉各种常用的生物学和医学数据库。

iii. 熟练掌握Python、Bash和R或其他生物信息学中常用的程序语言，熟悉Linux系统操作。

iv. 熟悉常用的生物信息分析软件，具备分析解释信息的能力。

v. 有测序数据分析、大数据分析经验，良好的统计学背景者优先。

b. 实验：

i. 具有分子生物学、细胞生物学、遗传学、病理学及微生物学等相关专业的研究背景，有代谢研究经验者优先。

ii. 熟练掌握分子生物学、细胞生物学、遗传学、免疫学、动物实验及微生物学等相关实验技术；

iii. 熟练测序原理、掌握测序前样本处理，包括但不限于脂肪细胞scRNA-Seq测序、PRO-Seq测序、ATAC-Seq测序、宏基因组测序以及ChIP-Seq测序，并可以及时发现测序样本处理过程中的问题。

ⅳ. 熟悉表观遗传、基因转录后修饰、细胞分化等相关知识者优先。

(2) 生物医学信息学

i. 具有知识库、数据库和网站建设、知识图谱、自然语言处理、医学图像处理

等方面经验。

ii. 有机器学习或深度学习背景优先；有医学或生物学背景优先。

(3) 生物医学文献审编及本体构建

i. 具有熟练和准确的英文文献阅读能力。

ii. 对于生物的各领域有较宏观的把握，有代谢和药学和细胞动物模型等方面知识者优先。

iii. 无需做实验，无需计算背景。能够与偏计算背景的研究人员有效沟通。

(4) 药用植物基因组学及合成生物学

运用植物基因组学和转录组学等方法研究植物有效成分的合成途径。应聘者满足a或b任意一项即可。

 

a. 植物基因组学：

i. 具有生物信息学，进化基因组学，数量遗传学等领域的博士学位；

ii. 熟悉二代与三代测序数据分析

iii. 可以熟练使用Linux操作系统的相关命令，编写Bash脚本。具有良好的计算机编程能力，掌握至少一种高级编程语言（包括Python）。具有良好的逻辑思维能力

b. 合成生物学：

i. 具有植物学相关专业博士学位；

ii. 负责烟草等模式和药用植物的培育，开展植物组织培养、转基因植株构建；

iii. 运用合成生物学的手段合成优质的植物天然产物；

iv. 具有植物组织培养、转基因植株构建经验，熟悉烟草等模式植物培育者优先；

v. 具有植物合成生物学知识者优先。

(5) 化学信息学

构建药用植物数据库，利用网络药理学、药物协同作用等现代研究方法，发现中草药中治疗疾病的有效成分以及作用机理。开发新的机器学习与人工智能计算方法加快这一过程的实验验证。

i. 具有化学、化学信息学、药学、生物信息学及计算机科学等领域的博士学位；

ii. 掌握科学计算编程及脚本语言（ Python/R/Bash script），以及数据库及网站建设，熟练使用Linux操作系统；

iii. 熟悉常用机器学习算法并有实际工程经验，对常用深度学习框架有一定了解；

iv. 掌握常用的化学信息学软件或网站（RDkit、 CDK、NCBI、ChEMBL、BindDB等 ）；

v. 有化学信息学和植物生物信息学研究背景者优先。

三、待遇

在站期间待遇、科研业绩要求、以及出站后留院要求按四川大学华西医院博士后管理相关规定执行，特别优秀者按项目需要提供国内外知名研究机构进行学习交流的机会。

四、应聘办法

应聘者请将详细的个人简历（含学习工作经历，论文成果清单和联系方式），工作总结以及三个推荐人（含博士导师）的联系方式同时电邮至苏老师邮箱（邮件标题注明“生物医学大数据中心博士后”）。

苏老师(suzehao@wchscu.cn)，电话：15882226303；

此招聘长期有效。

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