npj Microbiomes|细菌群落的整体涌现特性诱导了拟南芥的干旱抗性(一作解读)

点击蓝字

关注我们

9192f926b3e54b45e8ba9ed71750d82c.png

题目:Emergent bacterial community properties induce enhanced drought tolerance in Arabidopsis

细菌群落的整体涌现特性诱导了拟南芥的干旱抗性

通讯作者:Søren J. Sørensen & Mette Burmølle

第一作者:杨楠(博士研究生)

单位:哥本哈根大学生物系

原文链接:https://www.nature.com/articles/s41522-021-00253-0

摘要

      干旱严重限制了植物生产且全球变暖正在加重对作物的干旱胁迫。很多资料已经揭示了某些单个菌株能够影响植物的胁迫抗性。然而,微生物群落的整体涌现特性(emergent properties)对植物干旱抗性的影响在很大程度上还未被探索。一个由四个细菌组成的微生物小群体(嗜根寡养单胞菌, 黄单胞杆菌, 氧化微杆菌和解淀粉类芽孢杆菌,缩写为SPMX)比群体中单个成员能够协同地产生更多生物膜(bioflims)和生物量。因此,我们在拟南芥的根际接种了微生物群体SPMX来调查它对干旱胁迫下的植物和其根际微生物组的影响。我们发现SPMX显著地提高了植物在21天干旱胁迫下的存活率,诱导了植物的干旱抗性,而SPMX中的个体成员没有提高植物的干旱抗性。这个结果表明植物提高的干旱抗性来源于SPMX潜在的整体涌现特性。此外,增加的干旱抗性与SPMX处理后植物持续的叶绿素含量和内源的脱落酸(ABA)信号传导相关。我们还进一步发现接种的SPMX帮助稳定了植物根际微生物群落的结构和多样性。这些由SPMX诱导的变化有助于植物在干旱中生长,同时也潜在地增加了植物的干旱抗性。这项工作可能有助于启发未来探索微生物群落的整体涌现特性来提高植物抗干旱胁迫。

主要结果图片

057c24b3b07428be43be393f87447b09.png

图1:SPMX以及群落个体对拟南芥在21天干旱胁迫下存活率的影响。实验设计(a),菌落形态(b),SPMX的整体涌现特性提高了干旱抗性(c-f),SPMX在植物根部形成生物膜(g)。

5de03d5d0265daeb5ea09d0721243f2c.png

图2:SPMX对拟南芥植物在干旱中生长表型的影响。

780105bc7947d92d31c75d271b3e288c.png

图3:SPMX诱导了内源ABA合成基因的表达(a-b),相应外部的干旱胁迫压力基因表达水平降低(c-d)。SPMX影响ABA信号通路示意图(e)。

e40257eeb28db8df2109215da3e1d871.png

图4:SPMX于正常(under water)和干旱条件(under drought)下在根部相关的微生物群落中(rhizosphere and rhizoplane)的相对丰度比较。

db29dd3b55c7ff485d2a6ff9df73ab3d.png

图5:干旱胁迫和SPMX分别对植物根部微生物群落(rhizosphere and rhizoplane)的组成和多样性的影响(a-c)。随机森林(d)。

猜你喜欢

10000+:菌群分析 宝宝与猫狗 梅毒狂想曲 提DNA发Nature Cell专刊 肠道指挥大脑

系列教程:微生物组入门 Biostar 微生物组  宏基因组

专业技能:学术图表 高分文章 生信宝典 不可或缺的人

一文读懂:宏基因组 寄生虫益处 进化树

必备技能:提问 搜索  Endnote

文献阅读 热心肠 SemanticScholar Geenmedical

扩增子分析:图表解读 分析流程 统计绘图

16S功能预测   PICRUSt  FAPROTAX  Bugbase Tax4Fun

在线工具:16S预测培养基 生信绘图

科研经验:云笔记  云协作 公众号

编程模板: Shell  R Perl

生物科普:  肠道细菌 人体上的生命 生命大跃进  细胞暗战 人体奥秘  

写在后面

为鼓励读者交流、快速解决科研困难,我们建立了“宏基因组”专业讨论群,目前己有国内外5000+ 一线科研人员加入。参与讨论,获得专业解答,欢迎分享此文至朋友圈,并扫码加主编好友带你入群,务必备注“姓名-单位-研究方向-职称/年级”。PI请明示身份,另有海内外微生物相关PI群供大佬合作交流。技术问题寻求帮助,首先阅读《如何优雅的提问》学习解决问题思路,仍未解决群内讨论,问题不私聊,帮助同行。

c05cbebecb1ed59480a6f6a67e4c45b8.png

学习16S扩增子、宏基因组科研思路和分析实战,关注“宏基因组”

点击阅读原文

评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值