微生物所东秀珠组与北大深圳研究生院余珂组联合招聘启事

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基于设计、改造及构建新的微生物功能细胞,以应用于特殊水环境治理过程中的需求,我们拟联合招聘特别研究助理(博士后)2-3名。 

合作导师

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中国科学院微生物研究所(http://www.im.cas.cn)是隶属于中国科学院的科研事业单位,成立于1958年12月3日,目前已成为国内外规模最大的国立综合性微生物学研究机构之一。微生物资源前期开发国家重点实验室东秀珠研究组主要从事产甲烷古菌的遗传机制、生理生化、环境适应性以及合成生物学等相关研究,以产甲烷古菌为模式,聚焦:1)古菌的转录调控机制、RNA聚合酶的转录终止机制、发现新的转录调控因子及其功能机制,解析古菌的遗传新机制及转录调控新规律;2)遗传及调控元件的高通量智能挖掘技术及表征、标准化及适配技术及古菌表达平台的优化升级;3)产甲烷古菌的新代谢潜能、代谢通路及机制;4)极端微生物合成生物学研究,挖掘极端微生物模式底盘的绿色生物智造潜能。近年来,在相关领域取得多项突破性进展,在 Nucleic Acids Res (2017, 2020)、elife (2021)、Microbiology Spectrum (2021, 2022)、Environ Microbiol (2021)、PLoS Genet (2019)、RNA Biol (2020a, 2020b)、Mol Microbiol (2017)等国际著名杂志上发表了一系列高水平文章。研究工作得到国家自然科学基金委、科技部等的资助。

实验室简介:

https://www.x-mol.com/university/faculty/208413

合作导师

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北京大学深圳研究生院(https://www.pkusz.edu.cn/)是北京大学直属唯一的异地办学实体,是北京大学医学部等各学部的平级单位。环境微生物技术与生物信息学实验室(余珂课题组)关注于地表水环境微生物组及微生物在环境工程系统中的应用,开展由地表至地下的极端环境微生物组研究,开发1)痕量遗传物质采集、提取及测序技术,2)以信息学技术为支撑的多宏组学高精度数据解析和定向富集培养技术,及3)耦合合成微生物学和合成生态学的微生物群落改造或强化技术,以此发掘地球演化过程中的罕见或特殊微生物类群及其在特殊生物制剂生产、环境修复与改造中的应用潜能。课题组自有来自于全国100个淡、盐、碱湖泊及大量污染水体环境的1000余个生境条件的水样及沉积物样品;现有近100T二代或三代测序的宏基因组数据;具备强大的多组学分析能力,并可根据需求设计新算法及流程;课题组同时自有1500线程,内存从128G到3T不等的运算系统。近年来,在相关领域取得多项突破性进展,在Microbiome、Environmental Science & Technology、Science of Total Environment、Applied Environ. Microbiol.等国际著名杂志上发表了一系列高水平文章,并有望在近期发表其他高水平论文。研究工作得到国家自然科学基金委、科技部等的资助。

实验室简介:

https://www.x-mol.com/university/faculty/61533

招聘岗位:博士后

岗位职责:

‍(1)基于宏基因组、宏转录组等技术手段,高通量、高灵敏地挖掘工业和医疗常见污染物,如氯代化合物、抗生素及重金属等降解转化的元件及通路,解析目标污染物的降解机制;

(‍2)融合东秀珠老师课题组开发的dRNA-Seq、Term-Seq技术及余珂老师课题组自组开发的BASALT技术平台,解析复杂环境微生物基因组的污染物降解及调控元件;

(3)利用产甲烷古菌,进行上述常见污染物高效降解的合成生物学研究,主要包括底盘细胞的优化升级、高效降解元件和途径的人工智能设计和组装适配,从而得到目标污染物的高效降解人工合成菌株;并通过代谢网络分析优化及多组学分析等,解析人工合成菌株的环境适应性,认知其抗逆性机制,并通过分子改造提高其在实际环境应用中的鲁棒性;

(4)将人工合成菌株与实际环境菌株进行混合培养。解析群落中的物质交换关系,通过多宏组学指导定向控制微生物群落;

(5)协助合作导师,进行相关项目的撰写及申请;协助指导相关方向硕士研究生。

任职条件:

(1)具有生物信息学、分子生物学、生物化学或微生物学等相关专业博士学位(不限国籍),所学学科专业不在选定的参考目录中,但与岗位所要求的学科专业类同的招聘人员,可以主动联系招聘单位确认报名资格;

(2)已经获得或即将获得博士学位,年龄不超过35周岁(含);

(3)以第一或通讯作者在本专业主流学术期刊上发表过研究论文;有微生物遗传操作或宏组学解析相关研究经验者优先考虑;

(4)具有较强的中英文写作与交流的能力;

(5)热爱科学研究,实验能力强,具有积极进取的工作精神与团队合作精神,责任感强;

(6)身体健康、性格开朗。

工作地点及其他:

根据项目进度需求,将于深圳(组学数据解析)或北京(遗传操作)两地开展工作。

一期工作完成后,如未完成项目或希望继续完成。可申请做二期博后或者转为北京大学深圳研究生院助理研究员,继续从事研究。

薪资待遇: 

工资及福利待遇按北京大学深圳研究生院和国家有关规定执行。基础年薪12万,深圳市博士后补贴18万元每年(享受特殊税收政策)。特别优秀的申请者可申请额外补贴(最高32万每年,视深圳市相关政策而定)。课题组另有论文奖励等激励措施。

工资及福利待遇按中国科学院微生物研究所和国家有关规定执行。工资及福利待遇:年薪18-36万/年起(含五险一金),按中国科学院微生物研究所和国家有关规定执行,博士后其他相关待遇具体可参见:http://www.im.cas.cn/zp2018/bshzp/202102/t20210208_5891272.html。

应聘方式

1. 特别研究助理(博士后)岗位长期招聘,自发布招聘通知之日起至招满为止,符合上述条件的应聘者请将《应聘申请表》发送至lijie824@im.ac.cn或yuke.sz@pku.edu.cn,同时抄送dongxz@im.ac.cn,邮件主题注明:应聘东秀珠组&余珂组XXX岗位,附件形式的《应聘申请表》请注明“姓名+学校/现单位”,并另附个人简历;

2. 初选合格者电话或E-mail通知本人参加面试;

3. 参加面试者需提供:1)学历、学位证书及复印件;2)专家推荐信和其它可证明本人能力及水平的相关资料;

4. 通过面试者到指定医院进行体检,体检合格者将被录用。

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