糖转运蛋白调控拟南芥根部微生物群落的纵向定植
Sugar transporters spatially organize microbiota colonization along the longitudinal root axis of Arabidopsis
Article，2024-03-12，Cell Host & Microbe， [IF 30.3]
DOI：https://doi.org/10.1016/j.chom.2024.02.014
原文链接：https://www.cell.com/cell-host-microbe/fulltext/S1931-3128(24)00057-X
通讯作者：Eliza P.-I. Loo; Wolf B. Frommer
主要单位：德国杜塞尔多夫海因里希·海涅大学，分子生理学研究所，数学与自然科学学院
- Highlights -
根部微生物群落、代谢物和SWEET单向转运蛋白沿根轴排列；
SWEET糖单向转运蛋白组织与根部糖代谢途径相关；
sweet缺陷型植物中根部代谢物和微生物群落在空间上重组；
SWEET2、-4和-11;12在微生物群落的空间定殖中发挥作用。
- 摘要 -
植物根系在细胞结构、转录组谱、代谢状态和微生物免疫方面具有功能异质性。该研究假设轴向分化也可能影响根微生物群沿根轴的空间定植。作者开发了两种用于拟南芥根生长的系统，ArtSoil和CD-Rhizotron。作者将根部细分成三段，证明了不同的根内生和根际细菌群落定植在不同区段上，支持微生物群沿轴分化的假设。根代谢物分析揭示了不同根段不同的代谢物的富集和特异性。生物信息学分析和GUS组织化学染色表明，微生物诱导了SWEET2、4和12糖单转运蛋白的积累。对sweet突变体根段分析显示了空间代谢特征的改变和根内生微生物群落的重组。本研究揭示了根系代谢物与微生物定植之间的相互依赖关系及SWEET对微生物生态系统空间多样性和稳定性的贡献。
图形摘要
- 结果 -
图1 根部微生物群沿根纵轴的差异空间定殖。
A 野生型拟南芥Col-0在CD-Rhizotron上生长的表型。图中标出了不同根段分区，由到根尖距离决定。右图显示了根内和根际样品中基于Bray-Curtis相异性的CPCoA结果。
B 野生型拟南芥Col-0在ArtSoil上生长的表型。右图显示了根内和根际样品中基于Bray-Curtis相异性的CPCoA结果。
图2 沿根轴代谢物的多样性和空间特异性。
A 全长根和距根尖0-2、2-4和4-6 cm段代谢物的主成分分析（PCA）。颜色对应于图1A模式图中描绘的根区域。
B 热图描绘了各根段中指示代谢物的富集或消耗。基于代谢物的平均连接Pearson层次聚类。
图3 糖和土壤微生物存在/不存在的条件下，SWEETs沿根部积累的情况。
在添加或不添加1%蔗糖的½MS-salt培养基、接种微生物群或热杀死的微生物群的ArtSoil上生长的14日龄拟南芥幼苗的根部，与GUS报告基因融合的SWEETs的积累情况。
图4 sweet2、sweet4和sweet11;12缺陷型根部不同区域的代谢谱与野生型不同。
A sweet2、sweet4、sweet11;12和WT植株全根和根尖以上2、4、6 cm根段总代谢物的主成分分析（PCA）。
B sweet突变体各根段中相对丰度显著增加或减少的代谢物。
C 热图描绘了WT和sweet植物各自根段中指示代谢物的富集（或消耗）。
图5 sweet2、sweet4和sweet11;12缺陷型根部微生物定殖的空间特异性丧失。
A WT、sweet2、sweet4和sweet11;12拟南芥根内生细菌Bray-Curtis差异的CPCoA，受植物基因型限制。不同的颜色代表植物的基因型，每个基因型簇用中心体表示。
B WT、sweet2、sweet4和sweet11;12拟南芥的0-2、2-4和4-6 cm根段的内生细菌的Bray-Curtis距离。点的颜色和大小对应于Bray-Curtis距离的平均值。
C 代谢物-微生物（纲水平）的Spearman相关性。基于Spearman平均分层聚类对代谢物进行排序。点的颜色表示相关性。
参考文献
Eliza P.-I. Loo, et al., Sugar transporters spatially organize microbiota colonization along the longitudinal root axis of Arabidopsis. Cell Host & Microbe. 2024.
- 通讯作者简介 -
杜塞尔多夫海因里希·海涅大学
Eliza P.-I. Loo
博士后
Loo博士是杜塞尔多夫大学分子生理学研究所水稻“健康作物”团队组长。主要聚焦于植物与微生物群落的相互作用，特别是植物如何通过分泌碳源来供其微生物群落生长。致力于识别和阐明控制植物分泌碳的关键参与者的机制，以揭示植物与微生物群落之间复杂的相互作用关系，为植物疾病控制和提高作物产量提供新的思路和方法。
杜塞尔多夫海因里希·海涅大学
Wolf B. Frommer
教授、德国科学院院士
德国科学院院士，亚历山大·冯·洪堡教席，杜塞尔多夫大学分子生理学研究所所长，BIO-X成员。主要研究方向是植物细胞代谢物转运的分子过程和蛋白质，专注于探究植物如何利用转运蛋白吸收营养物质并将其穿过细胞膜。他研究了不同的转运机制，例如SWEET蛋白，能够将葡萄糖穿过细胞膜。这种机制在动物和人类细胞中也非常相似，因此他的工作也对医学应用（如理解癌细胞中的代谢过程）具有重要意义。
个人主页：https://www.molecular-physiology.hhu.de/en/resources-1/translate-to-english-proteomics-1-1
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