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RSS订阅原创 宏基因组/微生物组杂志简介及2020最新影响因子
2020年6月29日，2019年度的影响因子发布了，各种影响因子汇总的文章瞬间刷爆了朋友圈。作为本领域的专业公众号，每年都会借此机会系统介绍一下本领域的杂志，为同行文献阅读、文章投稿的杂...
2020-06-30 07:00:00
5977
原创 221.Beta多样性PCoA和NMDS排序
Beta多样性与PCoA和NMDS排序本节作者：文涛，刘永鑫版本1.0.4，更新日期：2020年6月27日本项目永久地址：https://github.com/YongxinLiu/Mi...
2020-06-29 07:00:00
26527
5
转载 环境&微生物期刊—FEMS Microbiology Ecology
期刊快览影响因子：IF=4.089，JCR2区官方主页：https://academic.oup.com/femsec杂志主编：Max Haggblom综合评价：口碑不错、评分4.5分个...
2020-06-29 07:00:00
8002
转载 Science：基于微生物条形码系统的高分辨率物源追踪技术
文章标题：Barcoded microbial system for high-resolution object provenance发表期刊：Science发表时间：2020.6第一...
2020-06-28 07:00:00
1166
转载 ISME：沈农栾军波组揭示水平转移基因的功能
DOI:https://doi.org/10.1038/s41396-020-0704-56月22日，沈阳农业大学植物保护学院博士研究生任飞荣和孙想以共同第一作者身份在The ISME...
2020-06-27 07:00:00
1246
转载 你狠心冲掉的便便，正成为许多肠胃病人的救星
新媒体管家自从1928年抗生素被发现以来，人类就好比在对抗细菌上获得了超级武器。遗憾的是，超级武器并没有带来全面的胜利。人类与细菌旷日持久的军备竞赛催生出了一批更加难缠的超级细菌。实际...
2020-06-27 07:00:00
398
转载 Microbiome：首个地球微生物“社会关系”网络在浙大绘制！
单个微生物看不见、摸不着，但却无时不在、无处不在。但微生物的功能绝非“分解者”这么简单，影响到温室气体的、绿色生产的、人体健康的方方面面，其群落组成和功能具有极高的复杂性。如...
2020-06-26 07:00:08
754
原创 EI：南土所褚海燕组发现农业土壤微生物核心菌群能够提升土壤生态功能
农业土壤微生物核心菌群能够提升土壤生态功能Abundance of kinless hubs within soil microbial networks are associated ...
2020-06-26 07:00:08
5006
转载 Microbiome: 再论扩增子功能预测分析(Picrust)的效果
Picrust作为扩增子测序功能预测的工具已经被广泛使用了。但是它会与真实情况存在较大的偏差，详见前文对Picrust局限性的介绍：PICRUSt不灵啦？别慌，它一直都不咋灵~此文中我推...
2020-06-26 07:00:08
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转载 知乎高赞：硕博生、留学生都在关注的几个公众号
导读：学习如逆水行舟，不进则退；只有坚持不断的学习，才能保持进步。今天给大家精心挑选的这几个优质的公众号，感兴趣的可以关注。我要考编制长按二维码【识别图中二维码】关注推荐理由：我要考编...
2020-06-25 07:00:00
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原创 MetagenoNets：在线宏基因组网络分析实操教程
宏基因组研究中网络分析已经十分普及，但却缺少整合的分析方法，限制了广大同行的使用。关于网络分析的基本步骤，和现在工具的比较，详见原文解读 - NAR：宏基因组网络分析工具Metageno...
2020-06-25 07:00:00
3346
原创 Sciences：Knight组发表尸体降解过程中的微生物组
Metcalf, J. L., et al. (2016). “Microbial community assembly and metabolic function during ma...
2020-06-25 07:00:00
598
转载 海南大学2020年申请考核博士研究生招生工作办法
海南大学2020年申请考核博士研究生招生工作办法时间: 2020/6/19 18:14:00 来源:研究生处为建立与国际接轨的博士研究生招生选拔制度，鼓励拔尖创新型人才脱颖而出，进一步提...
2020-06-24 07:00:00
1220
转载 上海巴斯德所在新型冠状病毒早期进化机制方面取得进展
中国科学院上海巴斯德研究所、中科院生物安全大科学中心上海分部崔杰研究组成员魏小曼、李祥等根据目前发表的新型冠状病毒（2019-nCoV）分析结果及公共数据库里上传的基因组比对结果，进行综...
2020-06-24 07:00:00
311
原创 全网最简单的网络图画法，小白福音包学包会
全网最简单的网络图画法，小白福音包学包会徐锐（助理研究员），广东省生态环境技术研究所，土壤微生物与宏基因组方向版本1.0.1，更新日期：2020年6月23日本项目永久地址：https:/...
2020-06-24 07:00:00
4985
3
转载 方差分解分析 (VPA)：定量不同环境因子对群落变化的解释比例
什么是VPAVPA，全称Variance Partitioning Analysis，中文成为方差分解分析，该分析的目的是确定指定的环境因子对群落结构变化的解释比例。我们使用CCA/RD...
2020-06-23 07:00:00
47161
17
原创 212.样本量和测序深度的Alpha多样性稀释曲线
样本量和测序深度的Alpha多样性稀释曲线本节作者：刘永鑫，文涛版本1.0.1，更新日期：2020年6月22日本项目永久地址：https://github.com/YongxinLiu/...
2020-06-23 07:00:00
23117
2
原创 Nature子刊：快速准确的微生物来源追溯工具FEAST
FEAST: 快速准确的微生物来源追溯工具FEAST: 快速期望最大化的微生物来源追溯FEAST: fast expectation-maximization for microbial...
2020-06-23 07:00:00
1522
原创 Nature子刊：微生物来源分析包SourceTracker
前一阵我们翻译Rob Knight的综述，1.8万字，让你熟读2遍轻松握掌微生物组领域分析框架、把握未来分析趋势。目前在宏基因组平台累计1.9万人次，热心肠平台首发阅读8500+，科学网...
2020-06-23 07:00:00
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1
转载 Nature综述：临床宏基因组学的应用与挑战
导读临床宏基因组学（mNGS）是对患者样本中微生物和宿主遗传物质（DNA和RNA）进行综合分析的一种新兴的诊断技术，这种新兴的方法正在改变医生诊断和治疗疾病的方式，其应用范围广泛，其应用...
2020-06-22 07:00:00
9137
原创 Nature：Gordon组采用甘露糖苷选择性抑制尿路致病性大肠杆菌
欢迎点击「宏基因组」关注我们！专业干货每日推送！《Selective depletion of uropathogenic E. coli from the gut by a FimH ...
2020-06-22 07:00:00
590
原创 Nature子刊：Knight组发布快速UniFrac算法
Striped UniFrac微生物组大尺度分析算法Striped UniFrac: enabling microbiome analysis at unprecedented scal...
2020-06-22 07:00:00
1053
原创 NAR：宏基因组网络分析工具MetagenoNets
MetagenoNets：微生物相关网络的综合推断和整合见解MetagenoNets: comprehensive inference and meta-insights for mic...
2020-06-21 07:00:00
2619
原创 Microbiome杂志和主编介绍
Microbiomehttps://microbiomejournal.biomedcentral.comMicrobiome位于BioMed Central旗下开放获取期刊，一审平均时...
2020-06-21 07:00:00
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转载 6月20日截止，请勿错过热心肠奖学金！
热心肠奖学金是由热心肠研究院于 2019 年推出的奖学金计划，每年评选一次。该计划旨在发掘、支持和鼓励优秀的中国学生，培养中国肠道领域学术及研发后备人才。首期热心肠奖学金已于 2019 ...
2020-06-19 07:00:00
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原创 223.主成分分析PCA
主成分分析 PCA本节作者：刘华，中国科学技术大学版本1.0.3，更新日期：2020年6月18日什么是PCA(Principal Component Analysis)相关背景在许多领域...
2020-06-19 07:00:00
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转载 临床试验中样本量确定的统计学考虑
样本量确定(sample size determination)，又称样本量估计(sample size estimation)，是指为满足统计的准确性和可靠性(I类错误的控制和检验效能...
2020-06-18 07:00:00
21211
原创 ISME：污水厂抗性组受细菌组成和基因交换驱动且出水中抗性表达活跃(西湖大学鞠峰))...
污水厂抗性组受细菌组成和基因交换驱动且出水中抗性表达活跃原英文标题：Wastewater treatment plant resistomes are shaped by bacteri...
2020-06-18 07:00:00
548
原创 Microbiome：南京农大团队在粘细菌捕食的生态学功能方面取得重要进展
掠食性粘细菌通过调节土壤微生物群落来控制黄瓜枯萎病A predatory myxobacterium controls cucumber Fusarium wilt by regulat...
2020-06-17 07:00:00
1969
原创 ISME：高手开杠-‘1%的微生物可培养’到底为哪般？
高手开杠-‘1%的微生物可培养’到底为哪般？（1）主要群落中高比例的细菌可培养High proportions of bacteria are culturable across maj...
2020-06-17 07:00:00
981
原创 Microbiome：资源区划所揭示不同放牧强度影响草甸草原土壤生产力的微生物学机制...
放牧引起的微生物组变化驱动草甸草原土壤有机碳的转化和生产力的提高Grazing-induced microbiome alterations drive soil organic car...
2020-06-17 07:00:00
1906
转载 华中农业大学Kenichi Tsuda组招收多名博士后
华中农业大学Kenichi Tsuda教授课题组招收多名博士后目前Tsuda教授团队已有教授2名，博士后 2名，博士研究生 3名，硕士研究生 7名，技术员2名。现大力招收相关专业感兴趣的...
2020-06-16 07:00:00
1004
转载 Nature子刊：华中农大Kenichi Tsuda组利用植物体内原位细菌转录及蛋白组学鉴定寄主免疫攻击的病原菌蛋白...
华中农业大学Kenichi Tsuda教授课题组利用植物体内原位细菌转录及蛋白组学鉴定了被寄主免疫系统攻击的病原菌蛋白北京时间2020年6月15日晚23时，植物学权威期刊《自然-植物》在...
2020-06-16 07:00:00
734
原创 合种油松3天领证
很多朋友都在支付宝里面玩过蚂蚁森林，为大家支持中国绿化公益事业的行动点赞。有没有羡慕小伙伴满满的植树证书，也希望自己为绿化做贡献，但又感觉自己的力量太渺小。现在机会来了，宏基因组公众号发...
2020-06-16 07:00:00
355
原创 EID：宏基因组测序在新发腹泻病毒鉴定中的应用
宏基因组测序在新发腹泻病毒鉴定中的应用撰文：李杰 常熟理工学院生物与食品工程学院责编：刘永鑫 中科院遗传发育所写在前面发现和鉴定新病毒以及确定新病毒与疾病的关系是预防、诊断和治疗新发病毒...
2020-06-15 07:00:00
1134
转载 结果方程模型（SEM）的理论和基本实现过程
写在前面之前有人点名希望写一个SEM，其实之前我并没有实际做过SEM，当时也没有多考虑就答应了，但是查了一些资料之后我就后悔了????这个东西实在是很不好理解，也非常的麻烦，全程都需要手...
2020-06-15 07:00:00
22410
转载 985助理教授与二本教授哪个水平高？
文章 |静寂冬来源 | 科研大匠（keyandajiang）目前我国发展迅速，人才更替加快。高校传统职称体系不断向国际靠拢，造成中国高等教育岗位职称体系混乱，建立健全高等教育职称...
2020-06-14 07:00:12
1714
转载 Nature：好导师的16个标准
“在任何学科领域，是否有一个好导师将决定学生的研究生涯初期的成败” ，什么样的导师是好导师呢？2005年，Nature创立了the Nature awards for mentoring...
2020-06-13 07:00:00
578
转载 MetaCoMET----核心微生物组分析在线工具
写在前面前两篇推文都是在介绍Venn图的绘制方法，其实在微生物群落研究中，Venn图的本质是识别样品中共有和特有的微生物，其中更重要的可能是共有的微生物，也可以说是研究样本中的核心微生物...
2020-06-12 07:00:00
3431
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转载 相对丰度会歪曲实际丰度，联合16S扩增子测序和总菌qPCR获得的绝对丰度可靠吗？...
英文题目: Complementing 16S rRNA Gene Amplicon Sequencing with Total Bacterial Load To Infer Abso...
2020-06-12 07:00:00
8086
Windows系统R语言4.0安装包合集(20200909)
2020-09-09
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