- 博客(43)
- 资源 (1)
- 收藏
- 关注
RSS订阅转载 国家微生物科学数据中心微生物组学数据汇交指南
科学家们往NCBI/EMBL/DDBJ等数据库提交的组学数据，也可以提交到国家微生物科学数据中心（NMDC，http://nmdc.cn/）了！感受数据提交服务亮点：线上全流程数据汇...
2020-08-31 16:33:00
1994
转载 这个为生信学习打造的开源Linux教程真香！！！
1 Linux初探，打开新世界的大门1.1 Linux系统简介和目录理解1.1.1 为什么要用Linux系统1.1.2 Linux系统无处不在1.1.3 免费的Linux系统来一...
2020-08-29 16:28:42
514
转载 再读《数量生态学：R语言应用》
我喜欢在海边捡贝壳，我喜欢在草原上追逐群羊，我喜欢数天上的星星。我好奇，只有七秒记忆的鱼，如何找到回家的路。每个人都是天然的生态学家，有着对身边事物多样性以及其中蕴含的数量与空间关系的感...
2020-08-29 07:00:00
2921
转载 Nature | 李海等揭示肠道菌群参与塑造B淋巴细胞抗原受体组库
责编 | 兮B细胞作为构成获得性免疫的重要组成部分，其功能取决于B细胞受体 (B cell Receptor)重链可变区基因胚系VDJ重排形成的抗原受体多样性。大量单个特异性B细胞抗原...
2020-08-29 07:00:00
527
原创 121个人电脑搭建微生物组分析平台(Win/Mac)
121个人电脑搭建微生物组分析平台(Win/Mac)本节作者：刘永鑫 中国科学院遗传与发育生物学研究所版本1.0.3，更新日期：2020年8月27日本项目永久地址：https://git...
2020-08-28 07:00:00
2218
1
原创 宏基因组蚂蚁森林公益合种树项目，支持祖国绿化事业，让世界更美好
宏基因组蚂蚁森林公益合种团队。现诚招队友，带你3000~5000g能量种10~20万能量大树，每天浇水一千，每种树循环种。热爱种树、保证支付宝每天10点前浇水1000g，无水可自行退出，...
2020-08-28 07:00:00
357
转载 专属于教育界的定律，你知道哪一些？
听过“百分之一百二十的”哲学吗？就是“百分之百的努力”之后，再加“百分之二十的勉强”所以，失败的人什么都不做平常的人只做这一点成功的人多做一点点顶尖的人再多做一点今天，这几个学霸推荐...
2020-08-28 07:00:00
613
原创 Nature子刊：机器学习方法扩展了anti-CRISPR蛋白家族的所有成员
机器学习方法扩展了anti-CRISPR蛋白家族的成员Machine-learning approach expands the repertoire of anti-CRISPR pr...
2020-08-27 07:00:00
1958
原创 Windows10安装Linux子系统Ubuntu 20.04LTS，轻松使用生信软件，效率秒杀虚拟机
很多优秀的生物信息学软件，如QIIME、QIIME 2、LEfSe等没有Windows版，而使用VirutalBox虚拟机不仅效率低，而且挂载外部硬盘和使用中也经常遇到各种问题，配置和使...
2020-08-26 07:00:00
6022
原创 Nature子刊：加州大学伯克利分校Banfield组发现某些淡水湖泊中的大噬菌体或能加速好氧甲烷氧化...
某些淡水湖泊中的大噬菌体或能加速好氧甲烷氧化Large Freshwater Phages with the Potential to Augment Aerobic Methane O...
2020-08-25 07:00:00
1026
原创 252体现组间差异OTU模块的微生物网络图
252体现组间差异OTU/模块的微生物网络图本节作者：李雨泽 西北农林科技大学版本1.0.4，更新日期：2020年8月23日本项目永久地址：https://github.com/Yong...
2020-08-24 07:00:00
25003
11
原创 USEARCH —— 最简单易学的扩增子分析流程(中国总代理)
USEARCH —— 最简单易学的扩增子分析流程USEARCH中文帮助文档(USEARCH Chinese manual)USEARCH官方英文主页：http://www.drive5....
2020-08-23 07:00:00
1247
转载 Microbime：微生物组学领域的标准制定
简介 标题：Developing standards for the microbiome field微生物组学领域的标准...
2020-08-23 07:00:00
1374
原创 Science Bulletin：绝对丰度的植物根际微生物群落“扩增-选择”组装模型
Science Bulletin: 基于绝对丰度的植物根际微生物群落“扩增-选择”组装模型2020年3月7日，Science Bulletin在线发表中科院分子植物科学卓越创新中心/植物...
2020-08-22 07:00:00
1800
原创 Nature子刊：涵盖20多万个基因组的人体肠道微生物参考基因组集
Nature子刊:涵盖20多万个人体肠道微生物基因组的参考基因组集A unified catalog of 204,938 reference genomesfrom the human...
2020-08-21 07:00:00
5390
原创 245热图展示微生物组的物种和功能丰度或有无、距离矩阵
245热图展示微生物组的物种和功能丰度或有无本节作者：吴一磊 中科院微生物所版本1.0.7，更新日期：2020年8月13日本项目永久地址：https://github.com/Yongx...
2020-08-20 07:00:00
12871
原创 公益合种樟子松/新树专车3天领证
宏基因组蚂蚁森林公益合种团队。现诚招队友，带你2000~4000g能量种10~20万能量大树，每天浇水一千，每种树循环种。热爱种树、保证支付宝每天10点前浇水1000g，无水可自行退出，...
2020-08-20 07:00:00
326
原创 MicrobiomeAnalyst：一款综合的可视化微生物组学数据分析网页工具
陕西省微生物研究所 常帆主要研究方向为土壤微生态，同时负责服务器维护和相关流程搭建。简介文章简介MicrobiomeAnalyst，综合微生物组学数据网页工具，2017年发表在Nucl...
2020-08-19 07:00:00
5165
1
转载 病毒组研究的挑战-相关的新兴技术
作者：王硕，南京农业大学硕士在读，主要研究利用噬菌体防治土传病害。周刊主要展示LorMe团队成员优秀周报，每周定期为您奉上学术盛宴！本期周刊将土壤噬菌体与肠道噬菌体进行类比并为您介绍可...
2020-08-18 12:00:00
710
转载 易生信-宏基因组积微学术论坛：基于大数据整合准确预测土壤的枯萎病发生...
博彩众家之长，积微成就突破。为促进我国宏基因组研究领域的学术交流和技术分享，推动微生物组领域的发展，“宏基因组”公众号联合国内外优秀人才组织“易生信-宏基因组 积微学术论坛”，与同行在线...
2020-08-17 07:00:00
568
原创 微生物组-扩增子16S分析第10期(报名直播课免费参加线下2020.12)
福利公告：为了响应学员的学习需求，经过易生信培训团队的讨论筹备，现决定安排扩增子16S分析、宏基因组、Python课程和转录组的线上直播课。报名参加线上直播课的老师可在1年内选择参加同课...
2020-08-17 07:00:00
490
转载 100个在线生信小工具
写在前面在与生物相关的研究中，生信分析基本上已经成为了一个绕不开的过程，面对高通量测序的大量数据，我们可能需要在Linux系统中使用专门的生信分析工具完成，这些工具通常学习成本较高，对于...
2020-08-17 07:00:00
21679
原创 Nature：Rob Knight团队发现血液和组织微生物组可诊断癌症
Nature：血液和组织中的微生物组分析可作为癌症的诊断方法Nature [IF: 42.778]全文链接：https://doi.org/10.1038/s41586-020-2095...
2020-08-16 07:00:00
2594
转载 Nature灵魂拷问：微生物组数据一大堆，如何能改变人类健康？
这是《肠道产业》第340篇文章编者按：测序技术使得我们对微生物组的深入分析成为可能。如今，研究人员们可以探索体内有哪些微生物，以及它们与疾病之间的潜在联系。但是这些信息还不足以揭示微...
2020-08-15 07:00:00
681
原创 PhiSpy：在细菌基因组中识别噬菌体
PhiSpy：在细菌基因组中识别噬菌体PhiSpy: a novel algorithm for finding prophages in bacterial genomes that ...
2020-08-14 07:00:00
5215
原创 222Beta多样性限制性排序CPCoA/CCA/RDA/LDA
222Beta多样性限制性排序CPCoA/CCA/RDA/LDA本节作者：文涛，南京农业大学；刘永鑫，中科院遗传发育所版本1.0.5，更新日期：2020年8月12日本项目永久地址：htt...
2020-08-13 07:00:00
7617
转载 主题已放宽，科研UP主们速来Bio-protocol破浪吧
6月份本大赛发布以来陆续收到不少读者的反馈, 根据大家的建议，我们将延长投稿截止日期并放宽作品主题范围。具体信息一起来看吧：作为“共享科学技术”的先行者, Bio-protocol正在举...
2020-08-13 07:00:00
422
转载 BT：大豆皮堆肥过程中的物质转化、微生物群落组成和代谢功能演替
【题 目】Material conversion, microbial community composition and metabolic functional success...
2020-08-12 07:00:00
1509
转载 WR：城环所杨军组揭示亚热带水库浮游有壳虫群落构建受随机性过程影响比确定性过程更强...
有壳虫（又称有壳变形虫、或有壳肉足虫）是一类单细胞原生生物，其细胞被壳体所包裹，可以通过壳口伸出伪足进行摄食和运动。它们个体微小、分布广泛、多样性高，从热带到极地地区在淡水、半咸水和土壤...
2020-08-11 10:00:00
600
原创 公益合种油松专车3天领证
宏基因组蚂蚁森林公益合种团队。现诚招队友，带你2000~4000g能量种10~20万能量大树，每天浇水一千，每种树循环种。热爱种树、保证支付宝每天10点前浇水1000g，无水可自行退出，...
2020-08-11 10:00:00
213
原创 PICRUSt2分析实战：16S扩增子OTU或ASV预测宏基因组EC、通路、KO(200806更新)
PICRUSt2分析实战：16S扩增子OTU或ASV预测宏基因组更新时间：2020年8月6日PICRUSt推出了近7年，引用4000余次。现推出PICRUSt2，再次霸气发表于顶级期刊N...
2020-08-10 07:00:00
10275
原创 最后3天|扩增子16S分析第9期(报名直播课免费参加线下2020.8)
福利公告：为了响应学员的学习需求，经过易生信培训团队的讨论筹备，现决定安排扩增子16S分析、宏基因组、Python课程和转录组的线上直播课。报名参加线上直播课的老师可在1年内选择参加同课...
2020-08-10 07:00:00
438
原创 Nature子刊：HUMAnN2实现宏基因组和宏转录组种水平功能组成分析
HUMAnN2实现宏基因组和宏转录组种水平功能组成分析Species-level functional profiling of metagenomes and metatranscri...
2020-08-09 07:00:00
4539
转载 研究生应锻炼的24种能力
本文来源：“学位与写作”微信公众号以下介绍24种读研时可积累的能力，以便有效面对未来的职业生涯，尤其是面对非学术型职业生涯。事实上，部分能力对读研阶段本身也非常重要。1适应能力...
2020-08-08 07:00:00
414
转载 Nature综述|预测生物学：微生物复杂性的解析、模拟与应用
点击上方「蓝字」关注我们论文信息原文标题：Predictive biology: modelling, understanding and harnessing microbial co...
2020-08-07 07:00:00
4928
转载 Nature子刊：微生物系统的功能与功能冗余
【论文题目】Function and functional redundancy in microbial systems【期刊名称】Nature Ecology & Evolu...
2020-08-06 07:00:00
8472
原创 ISME：二型糖尿病患者中与牙周炎相关的龈下菌群
二型糖尿病患者中牙周炎相关的龈下菌群The ISME Journal [IF: 9.18]DOI：https://doi.org/10.1038/s41396-019-0544-3发表日...
2020-08-05 07:00:00
1527
转载 微生物绝对定量研究知多少
目前细菌群落研究常用的技术是16S相对定量扩增子测序，而最近越来越多的研究者开始采用绝对丰度（即菌群的实际数量）对细菌群落进行绝对定量研究，今天小编就微生物绝对定量研究的一些常见问题在此...
2020-08-04 07:00:00
9197
转载 微生物群落基于KEGG预测功能的丰度分布图绘制
功能预测在基于16S rRNA扩增子的研究中，因为了解微生物群落功能的需要，我们经常会使用一些软件工具对16S rRNA扩增子数据进行功能预测，比如PICRUSt2。这些功能预测的结果大...
2020-08-04 07:00:00
30094
83
原创 细菌绝对定量的方法总结
细菌绝对定量方法总结背景：目前根据测序得到的微生物的相对含量可以看到微生物的相对变化情况，但是其并不能提供物种丰度变化的程度和方向的信息，忽略了微生物总体变化情况，因此，微生物的绝对定量...
2020-08-03 07:00:00
8563
Windows系统R语言4.0安装包合集(20200909)
2020-09-09
空空如也
TA创建的收藏夹 TA关注的收藏夹
TA关注的人