Roary结果中有基因组丢失怎么办

Roary结果里面有基因组没在结果里出现？？！

看看是不是结果文件夹里有一个文件夹叫fixed_input_files
如果有，你可以检查一下自己提交的gff文件里是不是每个不同的ORF（可以理解为基因）都在最后一列ID有自己独特的编号。
#注意： 是在所有文件中都要独特的ID，不仅仅是基因所在的这一个文件哦。所有参与计算的基因都要有自己的uniq ID

修改不独特的编号之后应该就没事了。