PSSM矩阵的生成(ncbi-blast-2.9.0±win64)
参考链接:https://blog.csdn.net/sxz940613/article/details/97102046
https://blog.csdn.net/sxz940613/article/details/83993804
https://blog.csdn.net/cpc784221489/article/details/88879650
1.下载ncbi-blast,下载地址为:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/,选择适合自己电脑的。我下载的是ncbi-blast-2.9.0±win64.exe
2.安装及环境变量的配置
下载完成后运行ncbi-blast-2.9.0±win64.exe,可自行选择安装目录(D:\protein\ncbi-blast-2.9.0\blast-2.9.0+)因为自己第一次弄把安装路径弄得有点繁琐。
然后配置环境变量:计算机右键属性——高级系统设置——环境变量
新建变量BLASTDB(D:\protein\ncbi-blast-2.9.0\blast-2.9.0+\db)——配置path路径(在后面加上(“;D:\protein\ncbi-blast-2.9.0\blast-2.9.0+\bin”))完成环境变量配置。
3、数据库构建
可以在https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/db/上下载自己需要的进行构建
因为自己只想做一个简单的实验&#
PSSM矩阵的生成(ncbi-blast-2.9.0+-win64)
最新推荐文章于 2023-05-19 12:08:49 发布
这篇博客介绍了如何使用ncbi-blast-2.9.0+在Windows环境下生成PSSM矩阵。首先,从ftp.ncbi.nlm.nih.gov下载并安装ncbi-blast软件,配置环境变量。接着,下载所需数据库并在DOS命令行中使用makeblastdb命令创建本地数据库。最后,通过psiblast.exe生成PSSM文件,得到1.pssm文件,该文件可以用记事本打开查看。
摘要由CSDN通过智能技术生成