天津超算测试使用总结

近期天津超算有测试使用，总结一些需要主要的点

在登录节点 加载自己所需要的模块
如使用gromacs 加载模块
module add Intel_compiler/16.0.3
module add MPI/Intel/IMPI/5.1.3.210
module add fftw/3.3.4-icc16-IMPI5.1
module add gromacs/5.1.2-single-icc16-IMPI5.1

加载后用module list查看下是否加载成功

然后在登录节点编写脚本run.sh

#!/bin/bash
yhrun -N 2 -n 56 gmx_mpi mdrun -deffnm md_0_100 -ntomp 1

这里不知道是不是用-s 指定md.tpr,看到有人写的指定，自己没指定。

然后yhbatch 提交作业，这样即使断开网任务还会继续跑。

yhbatch -N 2 -n 56 -p TH_HPC2 run.sh 

这里要注意是前处理不要交到计算节点去算，自己先在登录节点用yhbatch 提交作业后，然后yhq 查看自己使用的计算节点，运行后可以看到节点以及任务 ID

• List item

yhcancel取消用户运行的任务，命令为yhcancel jobid。jobid可通过
先由yhq命令查看。