本文参考Anaconda查看、删除、增加channel 、Anaconda查找源及配置清华镜像几篇文章,学习对Anaconda中Channel的设置等方法。
之前在安装软件时看到大家都在说尽量使用Anaconda来安装,这样可以连同软件依赖的包一起安装,我自己才装了SRA Toolkits和Anaconda两个软件,都是从Firefox网站下载后使用bash命令安装,另一个FastQC是Ubuntu系统自带的,使用apt-get install fastqc 命令就装上了,因此还不懂大家说的依赖包,今天在学RNA-seq时需要使用其他软件,因此先回过头来看看Anaconda怎么使用。
补充参考文章:
conda的安装与使用(2019-6-28更新)
RNA-seq(1) :用conda安装RNA-seq所需要的工具
RNA-seq基础入门传送门
清华镜像源官网:Anaconda 镜像使用帮助
软件介绍
Conda is a tool for managing and deploying applications, environments and packages.
命令用法
usage: conda [-h] [-V] command ...
详见: conda --help
查看自己Anaconda的设置
(base) zexing@DNA:~$ conda info
active environment : base
active env location : /f/xudonglab/zexing/miniconda3
shell level :