药学视角零基础复现基于IEU数据库的孟德尔随机化在线分析（一）——R、R Studio的安装及R Studio简介

一、R语言的安装

R语言的安装相信对于做过生信、NMA、临床研究数据处理等研究的药学科研人已经不陌生了，但还是想要从头讲起，因为对于初入科研数据分析的小白来讲，走的每一步都是需要摸索需要耗费大量的时间和精力去研究一个并不属于本专业的事物。

因为自己淋过雨，所以想为后来人撑起伞。

言归正传

1、从官网下载R的安装包

打开网址Index of /bin (r-project.org)

选择最后一个【windows】

 选择第一个【base】

点击【Download R-4.4.1 for Windows】即进入下载界面

2、安装R的安装包

双击左上角下载好的安装包后弹出右下角的选择语言框，点击【确定】。

点击【下一步】

点击【下一步】

点击【下一步】

点击【下一步】后就生成了桌面的快捷方式。

这就完了嘛？不！我们还需要一个辅助软件，以更好的应用R。

二、RStudio的安装

点击网址：Download RStudio | The Popular Open-Source IDE from Posit

点击右上角的蓝色【DOWNLOAD RSTUDIO】

一定要拉到下面装这个【RStudio Desktop】，点击蓝色的那个【DOWNLOAD RSTUDIO】

又要注意了昂，选右边那个，红色箭头指的那个。

接着下载即可。

双击打开安装包

点击【下一步】

点击【下一步】

点击【下一步】

安装完成后打开桌面上的【RStudio】，如下图所示。

我相信第一次打开的同学跟我当时的感觉一样：这什么啊！四个框框！！这么复杂？！！！不想学了。

三、RStudio简介

Rstudio的功能很多，但是对于学习孟德尔随机化的数据处理而言我们没有必要都去学习和了解，仅需要学习自己用得到的那几个常用功能和区域即可。

1、脚本文件窗口

这个窗口用于导入我给大家分享的脚本文件，简而言之就是代码文件。

首先将光标放在想要运行代码的首行，然后点击【RUN】即可运行。

这两个按钮强烈不建议新手点，稳扎稳打的一步一【RUN】即可。

例如我运行library(TwoSampleMR)，就会加载(TwoSampleMR)这个安装好的R包

加载好了以后就会再次弹出一个蓝色的右箭头和闪烁的光标

显示曾经执行过的历史命令代码

 getOption("repos")

查看当前R包的下载源

# R包  CRAN镜像源修改
options(repos=structure(c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")))
# R包  bioconductor（生物信息相关R包）镜像源修改
options(BioC_mirror="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor")
options(BioC_mirror="https://mirrors./bioconductor/") 

以上镜像源修改的代码看看就好，下一章安装孟德尔随机化所有相关的R包时会有详细的操作步骤。

这就是R、R Studio的安装及R Studio简介，下一章将进行基于IEU数据库的孟德尔随机化在线分析的R包的安装以及访问令牌的获取和环境部署。