药学视角零基础复现基于IEU数据库的孟德尔随机化在线分析（三）——IEU数据库的筛选及在线数据分析实操

一、IEU数据库的筛选

打开网址：IEU OpenGWAS project (mrcieu.ac.uk)

在框内输入你想查询的暴露因素，例如Mineral and other dietary supplements（矿物质及其他膳食补充剂）

接着选取自己想要研究的的暴露因素的【GWAS ID】，以第一个ukb-b-7043为例。

然后检索结局指标，【stroke】

选择数据集ebi-a-GCST90038613作为结局指标。

二、在线数据分析实操

打开RStudio我分享的脚本文件，复制暴露因素的GWAS ID到下图的指定位置。

复制结局指标的GWAS ID到下图的指定位置

加载TwoSampleMR、ieugwasr两个包

加载访问令牌

下载暴露因素的数据

展示第一列前四行的数据

获取所有的列名

获取结局数据

统一效应等位与效应量（Harmonization），协调或整合暴露数据和结局数据，以确保它们具有相同的格式和结构

展示数据内容

默认使用五种方法开始MR分析

查看当前支持的统计方法

指定其他方法，以英文逗号为间隔。

beta 转换 OR 值

异质性检验

也可以像 mr() 函数那样，指定方法进行检验。

水平多效性检验

散点图

要是只想展示某几种方法，在进行 MR 分析 的步骤时，指定方法即可

森林图

和上面一样，想展示指定方法的结果，在函数中指定即可。

留一图

漏斗图

图片的导出

选择导出图像后，选择图像的格式

至此，恭喜您完成孟德尔随机化的数据处理和图像导出！

RStudio的脚本文件分享在下一篇文章中，已设置为为免费获取。

如有相关的关注公众号做任务获取下载码等行为，是CSDN设置的，作者本人还是本着学习分享交流的态度：

Equalizing knowledge and breaking down academic barriers！