药学视角零基础复现基于IEU数据库的孟德尔随机化在线分析（二）——R包的安装以及访问令牌的获取

已于 2024-07-16 15:03:44 修改
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分类专栏： 药学数据分析专栏 文章标签： 数据库 r语言 开发语言
于 2024-07-16 14:58:49 首次发布
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一、R包的安装

打开Rstudio

加载我分享的脚本文件，文件将分享在《（四）在线处理IEU数据MR的脚本文件》，进行下载。

open以后是这样的

然后光标放在第二行，点击RUN

依次执行安装相关的R包，不要闲多，以后也会用到，一次性安装完了省事儿。

首先修改镜像

options(BioC_mirror="https://mirrors./bioconductor/")

然后安装BiocManager

install.packages("BiocManager")

接着继续修改镜像

options(BioC_mirror="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor")

安装剩下的四个包

BiocManager:
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好多同学询问孟德尔随机化的问题，我再来尝试着梳理一遍，希望对大家有所帮助，首先看下图1分钟，盯着看将下图印在脑海中：上图是工具变量（不知道工具变量请翻之前的文章）的模式图，明确一个点：我们做孟德尔的时候感兴趣的是x和y的关系，也就是小b，但是我们直接去跑x对y的回归肯定是不对的，因为有很多的U，因此我们借助工具变量G（关于工具变量我们之前的文章有详细的解释，请自行查阅），去估计我们感兴趣的小b。
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