ReaxFF 是新一代的分子力场,能够模拟化学反应过程中键的形成和断裂,从而更好地捕捉到分子间的相互作用。目前,ReaxFF MD 模拟方法已应用于复杂反应过程如热解、氧化、催化反应等反应机理的研究。此外,ReaxFF 还可以用于研究氧气与真实硅石表面的相互作用,以及有机分子热分解的 LAMMPS 模拟等研究。总之,ReaxFF 反应力场是一种具有广泛应用前景的分子力场,能为分子动力学模拟提供更为准确的描述和预测。此外,ReaxFF 还具有模拟速度快的优点,能够处理较大体系的化学反应过程,为材料科学、化学工程等领域的研究提供了有力的工具。
ReaxFF 反应力场计算开发技术与应用
第一天 上午
ReaxFF 基础 理论
- ReaxFF 反应力场概述
1.1. ReaxFF反应力场的发展历程和基础
1.2. ReaxFF反应力场参数分枝与详解
1.3. ReaxFF反应力场的应用领域
第一天 下午
ReaxFF 基础入门
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- ReaxFF ReaxFF 反应力场基础入门
2.1. 所需输入重要文件详解包括 control, geo, ffield等文件
2.2. 结合实例,讲解输入文件命令行,输出文件
2.3. ReaxFF反应力场简单实例操作及结果查看
2.4. ReaxFF反应力场运行软件安装和配置(standalone ReaxFF,LAMMPS)
2.5. ReaxFF 反应力场的选取和准备
第二天 上午
ReaxFF 计算软件
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- 分子建模,可视与 分子建模,可视与 计算 软件
3.1. 建模软件gview, material studio
3.2. 可视软件molden, VMD, OVITO
3.3. ReaxFF计算软件 standalone ReaxFF, LAMMPS
3.4. ReaxFF 特殊功能介绍:改变温度体积,产生特定比例混合物,设置
电荷,限制优化和扫描,添加删除分子,结果查看和分析等
第二天 下 午
ReaxFF 计算软件
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- Lammps Lammps 实 例操作
4.1. LAMMPS运行设置和后处理程序软件ChemTraYzer等的安装和配置
4.2. Lammps燃烧过程简单例子(模拟和分析)
4.3. LAMMPS高级算例:模拟化学摩擦过程(CMP):建模,loading和
shearing过程模拟,结果分析等
第三天 上午
ReaxFF 进阶实例
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- ReaxFF ReaxFF 进阶实例操作 , 理解 计算 模拟的 过程及 物理意义
实例操作: 实例操作: 溶液中的质子转移 (JPCB,JPCL 文献) )
5.1. 建立初始模型:重点注意事项
(minimization->nvt->compress->npt->nvt)
5.2. 输入文件设置, 开启输出unfolded坐标文件
5.3. 模拟步骤:能量最小化,压缩,系综平衡等
5.4. VMD查看结果分析:msd,扩散系数,rdf,sdf, 质子追踪等
第三天 下 午
ReaxFF 进阶实例
实例操作: 实例操作: 碳化硅表面石墨烯的生长( Chem. Mater 文献)
5.5. 建模与输入文件,表面选取与准备
5.6. 热分解法生长石墨烯,删除表面硅
5.7. cvd法生长石墨烯,添加乙炔分子
5.8. 5.8. 可视评估石墨烯质量 (模拟结果统计与可视化)
第 四 天 上午
ReaxFF 高级实例
- 量子化学软件 CP2K 入门
6.1. CP2K基本功能介绍
6.2. CP2K的下载和安装
6.3. CP2K的结构文件的建模
6.4. CP2K输入文件讲解和建立
6.5. CP2K输出文件介绍和可视化转化
第 四 天 下 午
ReaxFF 高级实例
- CP2K 结构优化、过渡态搜索和力场开发实例
7.1. CP2K研究有机分子在固体表面的吸附
7.2. CP2K过渡态计算以及结构和能量提取
7.3. ReaxFF反应力场开发所需文件详解
7.4. 提取CP2K计算结果实现ReaxFF训练集的构建
7.5. ReaxFF力场验证