DMU在windows下安装测试--外篇1

DMU在windows下安装测试–外篇1

1. 下载地址

下载地址:http://dmu.agrsci.dk/

64为电脑安装DMUv6-R5-2-EM64T.msi, 32为电脑安装DMUv6-R5-2.msi

2. 安装DMU

3. 测试DMU是否安装成功

3.1 保存测试数据

#dir.create("d:/ddmu-test")
setwd("d:/ddmu-test/")
library(devtools)
install_github("dengfei2013/learnasreml")
library(learnasreml)
data("animalmodel.dat")
data("animalmodel.ped")
dat = animalmodel.dat
ped = animalmodel.ped
dmuped = ped
dmuped$Birth = 2018
library(data.table)
# write.table(dat,"animal-model.txt",row.names = F,col.names = F)
fwrite(dat,"animal-model.txt",sep = " ",col.names = F)
fwrite(dmuped,"animal-ped.txt",sep = " ",col.names = F)

3.2 查看数据

3.3 将下面内容保存为:Uni_animal.DIR

$COMMENT
Estimate variance components for BWT
Model
y: BWT
fixed: BYEAR + SEX
random: ANIMAL

$ANALYSE 1 1 0 0
$DATA  ASCII (4,2,0) d:/dmu-test/animal-model.txt
$VARIABLE
ANIMAL MOTHER BYEAR SEX
BWT TARSUS
$MODEL
1
0
1 0 3 3 4 1
1
0
0
$VAR_STR 1 PED 2 ASCII d:/dmu-test/animal-ped.txt
$PRIOR
1 1 1 0.3
2 1 1 0.7

注意, 先建立txt, 然后将其重命名为:Uni_animal.DIR, 这里DIR是后缀, 而不是默认的txt

3.4 找到DMU的安装路径, copy文件

我的默认的安装路径如下:C:\Program Files (x86)\QGG-AU\DMUv6\R5.2-EM64T\bin

将这些文件copy到你的数据文件夹下.

数据文件夹里面的内容有:

3.5 打开cmd

• 进入D盘
• 进入文件夹:ddmu-test
• 查看当前文件内容

3.6 执行命令

run_dmuai.bat Uni_animal

3.7 查看结果

4. 最简单的方法: 全套资料下载

• 公众号回复:DMU下载数据, 里面有示例数据, 有bat文件, 还有DMU64位安装包
• 安装DMU, 默认路径即可
• 打开cmd, 进入数据文件
• 运行run_dmuai.bat Uni_animal即可成功

资料浏览:

• 数据:
  
• cookbook
  

5. 千里之行, 始于足下

能够运行DMU的示例文件, 只是第一步, 随后你可以看看示例数据是什么结构, 怎么调整自己的数据, 怎么调整DIR文件, 加油, 祝你好运.

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