Rosetta
病树前头
这个作者很懒,什么都没留下…
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rosetta使用相关——(待完善)
【代码】rosetta使用相关——(待完善)原创 2023-12-04 09:05:46 · 365 阅读 · 0 评论 -
anaconda3系列之pyrosetta安装
1.根据之前在rosetta官方网站注册的证书,在~/.condarc文件中加入下载链接。2.使用命令"conda create -n seq_des python3.7"搭建我的"seq_des"环境,此环境为python3.7。3.接下来在我的环境中使用命令"conda install pyrosetta"安装pyrosetta,在此安装过程值得注意的是,因为下载源的问题,安装过程极易报错:4.如果耐心等到解决,将会出现以下情况:...原创 2022-06-07 16:54:42 · 860 阅读 · 6 评论 -
pyrosetta学习详记
(2)演示者根据他们的实验,为了增加可用于Packing的rotamer,加入-ex1 和 -ex2,但是这会降低运算速度。8.检查操作过后的序列和原始序列,确保前后序列一致,也就是只对这些残基rotamers进行Packing。(1)为了加快演示速度,将松弛轮数由默认的5改为2(原文作者说在代码中修改有点难,我问号脸?(1)a single CDR loop(什么是CDR)TaskFactories:控制需要优化的残基。关键词:PackerTask。Packing:优化侧链。克隆一份初始的蛋白位置?原创 2023-11-30 15:30:32 · 1016 阅读 · 0 评论 -
pyrosetta学习相关(1)
1.2.3.4.5.6.7.8.9.10.11.12.13.14.15.16.17.18.19.20.原创 2023-11-30 15:27:45 · 354 阅读 · 0 评论