OpenMM
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病树前头
这个作者很懒,什么都没留下…
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OpenMM——做能量优化
在上述例子中,通过CustomExternalForce定义了一个势能表达式,该表达式包含了对指定原子的势能修正。这样,通过在模拟中使用该力,你可以实现对指定原子的位置进行固定。注意,fixed_atoms中的原子索引应该根据你的系统和需求进行调整。OpenMM是一个用于分子动力学模拟的开源软件包,它可以用于模拟分子系统的运动和相互作用。请注意,上述代码中的参数和设置可能需要根据你的具体情况进行调整。在实际使用中,你可能需要根据你的系统和模拟需求进行更详细的配置。在OpenMM中,你可以通过使用。原创 2024-08-21 14:52:15 · 165 阅读 · 0 评论 -
OpenMM——教程学习(1)
OpenMM教程学习原创 2024-04-28 16:36:20 · 1007 阅读 · 0 评论