4+ 非常经典的hub基因鉴定路线

原文公众号：一起实验网 对下述分析方法感兴趣或者没有研究思路的小伙伴，欢迎踊跃探讨！

分享一篇2022年9月发表在Front Physiol（IF：4.755）的文章《Identification of hub genes associated with acute kidney injury induced by renal ischemia-reperfusion injury in mice》（PMID: 36246123），作者通过对基因表达数据的综合分析，为缺血再灌注损伤-急性肾损伤的发病机制提供新的潜在生物标志物和见解。该思路同样适用于其他非肿瘤或肿瘤的研究。 背景&方法 背景：

急性肾损伤（AKI）是一种严重的临床综合征，缺血再灌注损伤（RI）是急性肾损伤的重要病因。

方法：

1.对数据集进行归一化处理；

2.分别鉴定两个个数据集中的差异表达基因；

3.DEG的GO功能和KEGG通路富集分析；

4.DEG的基因集富集分析；

5.DEG的PPI网络构建与hub基因的鉴定；

6.转录因-hub基因网络和miRNA-hub基因网络的构建；

7.hub基因相互作用药物的识别；

8.IRI-AKI病hub基因表达水平。

结果 差异表达基因的鉴定