使用Python进行多个机器学习模型、多个评价指标表格绘制(AUC、敏感度、特异度、F1值、约登指数、MCC、Kappa等)

一.常见模型评价指标简要说明

1.混淆矩阵

混淆矩阵是真实值和预测值的交叉表通过混淆矩阵可以构建出其他多个模型评价指标。

Class Positive Prediction Negative Prediction
Positive Class True Positive(TP) False Negative(FN)
Negative Class False Positive(FP) True Negative(TN)

2.AUC(Area Under Curve)

AUC(Area Under Curve), ROC曲线下面积,反映了模型整体的预测性能。越接近1,代表模型预测性能更好。

3.敏感度

敏感度(Sensitivity,Sen)敏感度与少数样本类别有关,它表示了阳性类样本的分类正确率。
S e n = T P T P + F N Sen = \frac {TP} {TP+FN} Sen=TP+FNTP

4.特异度

特异度(Specificity,Spe)与多数样本类别有关,表示了阴性类样本的分类正确率。
S p e = T N F P + T N Spe = \frac {TN}{FP+TN} Spe=FP+TNTN

5.PPV

阳性预测值(positive predict,PPV)指预测出的全部阳性样本中,真阳性所占的比例。表示判定为阳性类样本中,有多大概率预测是正确的。

P P V = T P T P + F P PPV = \frac {TP}{TP+FP} PPV=TP+FPTP

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您可以使用Python中的`AdaBoostClassifier`类来进行数据集的预测,并计算特异、准确敏感度,并绘制ROC曲线。下面是一种可能的实现方式: ```python import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt from sklearn.ensemble import AdaBoostClassifier from sklearn.metrics import accuracy_score, roc_curve, auc, confusion_matrix # 假设您已经准备好了训练集和测试集的特征和标签数据 X_train, y_train = ... X_test, y_test = ... # 创建AdaBoost分类器对象 clf = AdaBoostClassifier() # 使用训练集拟合分类器 clf.fit(X_train, y_train) # 对测试集进行预测 y_pred = clf.predict(X_test) # 计算准确 accuracy = accuracy_score(y_test, y_pred) # 计算混淆矩阵 tn, fp, fn, tp = confusion_matrix(y_test, y_pred).ravel() # 计算特异 specificity = tn / (tn + fp) # 计算敏感度(召回率) sensitivity = tp / (tp + fn) # 绘制ROC曲线 y_pred_proba = clf.predict_proba(X_test)[:, 1] # 获取正类的预测概率 fpr, tpr, thresholds = roc_curve(y_test, y_pred_proba) roc_auc = auc(fpr, tpr) plt.figure() plt.plot(fpr, tpr, label='ROC curve (area = %0.2f)' % roc_auc) plt.plot([0, 1], [0, 1], 'k--') plt.xlim([0.0, 1.0]) plt.ylim([0.0, 1.05]) plt.xlabel('False Positive Rate') plt.ylabel('True Positive Rate') plt.title('Receiver Operating Characteristic') plt.legend(loc="lower right") plt.show() ``` 请注意,您需要将训练集和测试集的特征数据存储在`X_train`和`X_test`中,标签数据存储在`y_train`和`y_test`中。此外,上述代码中的`...`表示您需要根据实际情况进行相应的数据准备和处理。 希望能对您有所帮助!如果有任何问题,请随时提问。

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