如何直接在unity3d中运行.net4.5等高级版本的机器码

PE格式，是微软Win32环境可移植可执行文件(如exe、dll、vxd、sys和vdm等)的标准文件格式。
普通Win32应用的PE文件里，PE格式的代码段里的代码就是程序的主要代码了，是以平台相关的机器码形式存储的；而对.NET Assembly而言，其代码主体是以MSIL（或者叫CIL）的中间代码形式存储在PE格式的“资源”部分而不是在代码部分；其PE格式的代码段里只包含一小块“桩程序”（stub），负责将程序控制权交给CLR去继续执行该assembly里的MSIL代码。也就是说，.exe后缀的.NETAssembly的PE格式代码段里其实只有这样一个函数调用：https://www.zhihu.com/question/27124375
_CorExeMain(...)
.dll后缀的则是：
_CorDllMain(...)

unity3D脚本编译与执行
把脚本编译成.NET dll(动态链接库)文件，这些托管代码的执行都是在mono的CLR上执行的。当编译链接的时候，编译器会根据dll版本号等信息来判断是否支持该dll中的代码，微软的.NET 生成的dll是无法通过编译的，要想执行微软.NET的代码，只有直接生成普通win32格式的文件，代码是与平台相关的机器码，而不是依赖于mono的CLR来执行的。

微软目前提供了一个可以直接编译成机器码的方案是.NET Native,但是仅仅支持windows store应用,详细参见：