GO、KEGG富集分析实例讲解

         “组学”、“数据挖掘”是近几年来我们经常听到的词汇，科研工作中也经常用到二代测序，不管送哪家测序公司进行测序或数据分析，结题报告中都会看到一个标准的分析套路：功能富集分析。说起功能富集分析，想必大家并不陌生，但要表述一下它的定义，又很少有人能回答的出（组会的时候，是不是经常会被导师这样cue到呢~~）。大部分科研工作者，对功能富集分析的最初了解，是从测序公司给我们的分析结果开始的。要知道朦朦胧胧的概念，就会导致对数据结果分析的不透彻，乃至不知如何让测序数据变得有意义。

        功能富集分析是什么？GO和KEGG为何物？怎么做功能富集分析才是最准确的？今天，我们就从这几个问题出发，仔细跟大家讲讲功能富集分析的由来、定义，并带领大家进行一个实例操作。

链接网址：

https://david.ncifcrf.gov/

 

 

数据库中给的例子用的是基因探针，我们可以使用自己的基因列表：

链接内容：

https://metascape.org/gp/index.html

 

 

 

Enrichr由于数据库架构在国外站点，国内有些网端可能打不开：

https://maayanlab.cloud/Enrichr/

 

 

 

一个典型go语言工作空间

bin/
    hello                          # command executable
    outyet                         # command executable
pkg/
    linux_amd64/
        github.com/golang/example/
            stringutil.a           # package object
src/
    github.com/golang/example/
        .git/                      # Git repository metadata
        hello/
            hello.go               # command source
        outyet/
            main.go                # command source
            main_test.go           # test source
        stringutil/
            reverse.go             # package source
            reverse_test.go        # test source
    golang.org/x/image/
        .git/                      # Git repository metadata
        bmp/
            reader.go              # package source
            writer.go              # package source