拿到一个蛋白以后,首先需求对蛋白停止全面的理解,所谓知彼知己方能百战不殆:
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蛋白二级构造预测:蛋白质的二级构造能够提供蛋白质的 α 螺旋、β 折叠和柔性区的散布状况。
http://www.compbio.dundee.ac.uk/jpred/ -
跨膜区预测:蛋白质的跨膜区的位置预测有助于我们理解蛋白质共有几次跨膜,肯定胞外域和胞内域的位置。
http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM-2.0/ -
信号肽预测:蛋白质的信号肽预测有助于我们理解蛋白质的一些特性,例如蛋白能否为分泌蛋白。
http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/ -
糖基化位点预测:糖基化位点预测,在蛋白的表达和结晶过程中有重要参考意义。
http://www.cbs.dtu.dk/services/NetOGlyc/ -
理化性质剖析:蛋白质的理化性质有助于我们理解蛋白质的局部特性,有助于蛋白质的纯化。
https://web.expasy.org/protparam/ -
亲水性疏水性剖析:剖析蛋白的亲水性和疏水性,为选择纯化办法提供参考。
https://web.expasy.org/cgi-bin/protscale/protscale.pl
俗话说的好,能表达的蛋白千篇一概,不表达的蛋白各有不同。这蛋白不表达的缘由有很多,能够从以下几点思索:
载体构建能否适宜——检查启动子、读码框、终止子等。某些基因含有许多稀有密码子,特别是起始密码子后15 个碱基内的,会显著影响蛋白的表达。
表达系统能否恰当——常见的有四大表达系统&#