AFEchidna示例14--添加权重变量

AFEchidna包可以给因变量添加权重变量,简单示例如下:

res21<-echidna(h3~1+Rep,
               weights='h1',
               random=~Fam,
               es0.file="fm.es0")

运行结果如下:

> res11<-echidna(h3~1+Rep,
+                weights='h1',
+                random=~Fam,
+                es0.file="fm.es0")

Running Echidna for analysis:  h3 

 Wed Aug 25 09:43:16 2021 
  Iteration     LogL eSigma NEDF
1         1 -2408.41  52260  554
2         2 -2356.22  56140  554
3         3 -2358.91  55050  554
4         4 -2358.80  60760  554
5         5 -2357.09  59670  554
6         6 -2355.57  58110  554
7         7 -2355.38  57460  554
8         8 -2355.38  57410  554
Wed Aug 25 09:43:16 2021 LogL Converged 
> Var(res11)
      Term    Sigma       SE   Z.ratio
1 Residual 57412.00 3619.000 15.864051
2      Fam   146.26   58.779  2.488304

AFEchidna包免费对外开放,仅用于学术研究,不可用于商业研究,否则造成的后果自负。

感兴趣者,可发邮件到yzhlinscau@163.com免费索取程序包。

参考文献:
Zhang WH, Wei RY, Liu Y, Lin YZ. AFEchidna is a R package for genetic evaluation of plant and animal breeding datasets. BioRxiv. DOI: 10.1101/2021.06.24.449740.

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