Rstudio安装org.Hs.eg.db

最新推荐文章于 2024-07-10 20:40:35 发布

ZH_DDong

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本文链接：https://blog.csdn.net/zh_ddong/article/details/119900413

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这篇博客记录了在Rstudio中安装org.Hs.eg.db包的过程，包括使用instal.packages()和BiocManager::install()尝试安装，解决包更新警告以及移除冲突包的问题，最终成功加载库的步骤。

摘要由CSDN通过智能技术生成

自己也是个小白，初次安装org.Hs.eg.db碰到好多问题，步骤总结如下：

第一，instal.packages（）安装，不行则换 BiocManager：：install（）

第二，如BiocManager不成，说明不是最新版本，可按提示安装最新版

BiocManager::install(version = '3.13') #由于R版本较新，按照提示中的相关信息，安装最新版本的

第三，再次安装

BiocManager：：install("org.Hs.eg.db")

第四，之后每个人碰到问题就不一样了，我遇到的问题是

类似于包不能因移除，而无法更新（有11个警告信息,不详细列举）

Bioconductor version 3.13 (BiocManager 1.30.16), R 4.1.0 (2021-05-18)
Old packages: 'gert', 'RCurl', 'readr', 'survival', 'XML'
Update all/some/none? [a/s/n]: 
a
#更新过后报错（中间代码省略）
package ‘stringi’ successfully unpacked and MD5 sums checked
Warning: cannot remove prior installation of package ‘stringi’ 
Warning: restored ‘stringi’<