在画这个图之前我们先来了解一些这类文章的研究思路。一般先寻找差异表达基因,然后通过Cox回归分析寻找跟生存显著相关的基因。然后基于这些跟生存显著相关的基因,利用LASSO Cox回归构建风险评估模型,计算风险分值。【1】
研究思路图
一般计算风险分值的公式为
其中Ei为模型中第i个基因的表达值,而βi为LASSO计算出来的系数。
得到了风险分值之后,我们就可以来画图了。根据上面Risk score公式,我们可以计算出每一个样本的Risk score,那么图A就很容易画了,就是根据所有样本的风险分值,从低到高排序,然后用散点图展示出来。取所有样本