下载并安装miniconda3
wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
安装时许可协议可打yes,默认目录为~/miniconda3,默认不运行conda直接回车
conda init #c初始化conda命令
conda -V # 查看版本号 4.6.14
python --version # 2.7.16
添加生物频道,才能找到生物学软件
conda config --add channels conda-forge
conda config --add channels bioconda
conda config --add channels r
添加清华源
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes
conda默认配置文件为 ~/.condarc ,如不存在使用 conda config --show-sources 查看配置文件位置
#不可用则修改环境变量
sudo gedit ~/.bashrc
#在最下面添加如下信息
export PATH=$PATH:/home/你的用户名/miniconda3/bin