8+脂肪酸代谢+预后模型

最新推荐文章于 2025-04-15 08:45:19 发布

生信风暴

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文章标签：零知识证明

本文链接：https://blog.csdn.net/2301_79430545/article/details/133638901

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研究构建了一个基于脂肪酸代谢的ccRCC预后模型，包含20个关键基因，能有效预测患者生存率和对PD-1/PD-L1治疗的反应。模型在多个队列中验证，具有高预测准确性，揭示了脂肪酸代谢与免疫微环境、JAK-STAT3信号通路的关联。

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今天给同学们分享一篇脂肪酸代谢+预后模型的生信文章“Fatty acids metabolism affects the therapeutic effect of anti-PD-1/PD-L1 in tumor immune microenvironment in clear cell renal cell carcinoma”，这篇文章于2023年5月23日发表在J Transl Med期刊上，影响因子为8.44。

透明细胞肾细胞癌（ccRCC）是肾脏恶性肿瘤的一种高度侵袭性和转移性亚型，与适应包括浸润免疫细胞和免疫调节分子的肿瘤微环境的代谢重编程有关。免疫细胞在肿瘤微环境（TME）中的作用及其与ccRCC中异常脂肪酸代谢的关系仍知之甚少。

1. 预测模型的构建

本研究共纳入309个与脂肪酸代谢相关的基因。经过TCGA数据集过滤、质量评估和数据处理，最终通过“limma”R包提取出96个DEG，结果表明62个DEG下调，34个DEG上调。热图和火山图用于可视化DEG（图1b，c）。预后模型是基于单变量和多变量Cox回归分析以及LASSO分析开发的（图1d，e）。最终，预后模型通过森林图可视化（图1f），由20个基因组成：HACD1、HPGD、ALOX15B、ABCD1、HMGCS2、CPT1B、TDO2、SCD5、PCCA、DPEP1、ALAD、ACADM、ACADSB、ACAT1、PLA2G4A、ALOX12B、IL4I1、ACAD11、HIBCH、LTC4S。风险评分 = （0.319240 * HACD1） + （− 0.084391 * HPGD） + （− 0.180228 * ALOX15B） + （0.459381 * ABCD1） + （− 0.063391 * HMGCS2） + （0.325758 * CPT1B） + （0.140669） * TDO2） + （− 0.029671 * SCD5） + （0.127550 * PCCA） + （− 0.067707 * DPEP1） + （− 0.342020 * ALAD） + （− 0.040588 * ACADM） + （2007年1月31日） * ACADSB） + （− 0.110134 * ACAT1） + （− 0.161595 * PLA2G4A） + （− 0.407284 * ALOX12B） + （0.280250 * IL4I1） + （− 0.028668 * ACAD11） + （− 0.158444 * HIBCH） + （− 0.766512 * LTC4S）。