今天给同学们分享一篇生信文章“HOPX is a tumor-suppressive biomarker that corresponds to T cell infiltration in skin cutaneous melanoma”，这篇文章发表在Cancer Cell Int期刊上，影响因子为5.8。
结果解读：
低HOPX表达表明SKCM预后不良，HOPX是一个良好的诊断标志物
TCGA数据库用于分析HOPX在各种正常和肿瘤组织中的表达。结果显示，HOPX的表达在25例中显著上调，包括ACC（肾上腺皮质癌）（p < 0.001）和BRCA（乳腺浸润性癌）（p < 0.001）（图1A），而与正常组相比，SKCM肿瘤组的HOPX表达要低得多（p < 0.001）（图1B）。基于GEO数据库的火山图结果也显示了SKCM患者中HOPX的低表达（图1C-F）。HPA数据库的临床病理数据也证实了这一点（图1G）。此外，数据分析显示，SKCM患者中不同年龄组的HOPX表达水平没有显著差异，但女性的表达水平高于男性（图S1A，B）。这可能意味着男性更容易患上SKCM，而且它可能发生在任何年龄，尽管需要更多的临床数据来证明这一点。然后，作者进一步分析了HOPX对SKCM的诊断和预后价值。受试者工作特性（ROC）曲线的AUC为0.744（图1H），表明HOPX对SKCM患者具有良好的诊断价值。此外，Kaplan-Meier（KM）曲线表明，具有高HOPX表达的SKCM患者具有更好的生存率（p = 0.005）（图1I）。列线图预测了SKCM患者的1年、5年和10年
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