医学图像公开数据集汇总

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CT 

名称	任务	部位	格式	数量
MSD-Lung	分割	肺	3D	96
MSD-Liver	分割	肝脏	3D	201
MSD-Spleen	分割	脾脏	3D	61
MSD-HepaticVessels	分割	肝门静脉	3D	443
MSD-Pancreas	分割	胰腺	3D	420
MSD-Colon	分割	结肠	3D	190
LUNA2016	检测/分割	肺结节	3D	888
LiTS	分割	肝脏	3D	210
CheXpert	分类	肺病灶	2D	224316
ChestX-ray	分类/检测	肺病灶	2D	112120
TCIA-QIN-LUNG	分割	肺非小细胞癌	2D	3954
4D-LUNG	分割	肺非小细胞癌	4D	20
NSCLC-Radiomics	分割/重建	肺非小细胞癌	3D	422
Vessel12	分割	肺血管	3D	20
ShenZhen-Hospital-Xray	分类	肺结核	2D	662
Montgomery-County-Xray	分类	肺结核	2D	138
IEEE802.3-COVID-ChestXRay	分类	肺炎	2D	5000
COVID-CTset	分类	肺炎	2D	63849
RSNA	分类/检测	肺炎	2D	29684
3DLSC-COVID	分类	肺炎	3D	1805
LIDC-IDRI	检测	肺结节	3D	1012
天池肺结节比赛	检测	肺结节	3D	3000
LNDB	分类/分割	肺肿瘤	3D	294
Lung-Nodule-Malignancy	分类	肺结节	2D	6690
DSB17肺癌预测	预测	肺	2D	-
Lung-PET-CT-Dx	检测	肺癌	3D	355
SIIM-ACR	分类/分割	气胸	2D	10679
CQ500	检测	脑出血	3D	491
RSNA-Intracranial-Hemorrhage	分类	脑出血	2D	-
KiTS19	分割	肾脏肿瘤	3D	300
MURA	分类	骨骼	2D	40561
RSNA-Bone-Age	预测	骨骼	2D	-
VerSe	分割	脊柱	3D	374

MRI

名称	任务	部位	格式	数量
MSD-Brain	分割	脑	4D	750
MSD-Hippocampus	分割	海马体	3D	394
MSD-Heart	分割	心脏	3D	30
MSD-Prostate	分割	前列腺	4D	48
RIDER-Breast	预测	乳腺癌	3D	5
Brain2019	分割	脑肿瘤	3D	626
Brain2021	分割	脑肿瘤	3D	2040
ISEG2019	分割	婴儿脑部	3D	23
ABIDE	分类	脑自闭症	3D	1102
ADNI	分类	脑阿尔兹海默	3D	819
QIN-PROSTATE	分割	前列腺癌	3D	15
PDMR	分割	胰腺癌	3D	20
SpineSeg	分割	脊柱	3D	172
MRnet	分类	膝盖	3D	1370
ACDC	分割	心脏	3D	150

超声

名称	任务	部位	格式	数量
EchoNet-Dynamic	分割	心脏	mp4	10300
HC18	分割	头围	2D	1334
BUSI	分割	乳腺癌	2D	780
CAMUS	分割	心脏	2D	-

内窥镜

名称	任务	部位	格式	数量
Kvasir-v1	分类	胃肠道	2D	4000
Kvasir-v2	分类	胃肠道	2D	8000
Kvasir-SEG	分割	胃肠道	2D	1000
Hyper-Kvasir	分类/分割/视频	胃肠道	2D/视频	110079图片/374视频

病理

名称	任务	部位	格式	数量
Malaria-Screener	分类	疟疾	2D	27560
PANDA	分级	前列腺	2D	10616
DSB18	分割	细胞核	2D	841
血细胞涂片	分类	血细胞	2D	12500
Cell-TRacking-2D+Time	细胞追踪	细胞	2D	-
BCNB	分类	乳腺癌	2D	1058
SNOW（合成）	分割	乳腺癌	2D	-
GasHisSDB	分类	胃	2D	245196
MHIST	分类	结肠	2D	3152
CRC100K	分类	结肠	2D	100000

多模态

名称	任务	部位	格式	数量
MedMNIST	分类	18部位	2D/3D	-
MedMNIST-v2	分类	18部位	2D/3D	-
CHAOS	分割	肝/肾/脾	3D	40/120
TCGA-LIHC	基因-图像	肝脏	基因组图/图像	237
StructSeg2019	分割	头/鼻/胸/肺	3D	28
QIN-Breast	预测	PET/CT/MRI	3D	67
MMWHS	分割	心脏	3D	20
PathVQA	VQA	病理	2D	32799/4998
AbdomenCT-1K	分割	腹部多器官	3D	1000

PET

名称	任务	部位	格式	数量
Lung-PET-CT-Dx	检测	肺癌	3D	355
ACRIN6688	化疗	乳腺癌	3D	83

OCT

名称	任务	部位	格式	数量
DRIVE	分割	眼底	2D	40
ODIR-5K	分类	眼底	2D	5000
STARE	分割	眼底	2D	400
CHASE-DB1	分割	眼底	2D	28
IDRiD	分割	视网膜	2D	516
RETOUCH2017	分割	视网膜积液	2D	70
REFUGE	分割	视杯视盘	2D	1200
FIRE	配准	眼底	2D	129
LAG	分类	青光眼	2D	11760
RITE	分割	静脉血管	2D	40
OLIVES	预测	眼底	2D	1268

皮肤镜

名称	任务	部位	格式	数量
SIIM-ISIC-Melanoma	分类	皮肤	2D	88.3k
ISIC2016	分类/分割	皮肤	2D	807/900
ISIC2017	分割	皮肤	2D	2000
ISIC2018	分类/分割	皮肤	2D	2594/10015
ISIC2019	分割/预测	皮肤	2D	25331
ISIC2020	分割/预测	皮肤	2D	33126
HAM1000	分类	皮肤	2D	10000
BCN20000	分类	皮肤	2D	20000

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