基于 matlab实现KPCA核主成分分析 数据降维 注释清晰

基于 matlab实现KPCA核主成分分析 数据降维 注释清晰
1.用于减少数据集的维数，同时保持数据集中的对方差贡献最大的特征
2.直接替换excel数据即可用
3.附赠案例数据 可直接运行

核主成分分析（Kernel Principal Component Analysis, KPCA）是一种非线性降维技术，它通过将数据映射到高维特征空间中，然后在该空间中执行传统的主成分分析（PCA）。KPCA能够捕捉数据中的非线性结构，从而提供更有效的降维。

下面是一个基于MATLAB实现KPCA的示例代码，并附有详细的注释，帮助你理解每一步的操作。

示例代码

function kpca_example()
    % 加载或生成数据集
    % 这里使用一个简单的二维数据集作为示例
    rng(0); % 设置随机种子以确保结果可重复
    data = generate_sample_data();

    % 数据可视化
    figure;
    scatter(data(:,1), data(:,2));
    title('Original Data');
    xlabel('Feature 1');
    ylabel('Feature 2');

    % 设置KPCA参数
    kernelType = 'rbf'; % 核函数类型：'linear', 'poly', 'rbf'
    gamma = 1; % RBF核的参数，仅当kernelType为'rbf'时使用
    numComponents = 2; % 要保留的主成分数量

    % 执行KPCA
    [transformedData, eigenvalues, eigenvectors] = kpca(data, kernelType, gamma, numComponents);

    % 可视化降维后的数据
    figure;
    scatter(transformedData(:,1), transformedData(:,2));
    title('Data after KPCA');
    xlabel('Principal Component 1');
    ylabel('Principal Component 2');
end

function data = generate_sample_data()
    % 生成一个简单的二维数据集，包含两个螺旋形的数据簇
    t = linspace(0, 4*pi, 100);
    x1 = cos(t) + randn(size(t)) * 0.1;
    y1 = sin(t) + randn(size(t)) * 0.1;
    x2 = 0.8 * cos(t + pi) + randn(size(t)) * 0.1;
    y2 = 0.8 * sin(t + pi) + randn(size(t)) * 0.1;

    data = [x1, y1; x2, y2];
end

function [transformedData, eigenvalues, eigenvectors] = kpca(X, kernelType, gamma, numComponents)
    % 计算核矩阵
    n = size(X, 1);
    K = compute_kernel_matrix(X, kernelType, gamma);

    % 中心化核矩阵
    one_n = ones(n) / n;
    K_centered = K - one_n * K - K * one_n + one_n * K * one_n;

    % 计算特征值和特征向量
    [eigenvectors, eigenvalues] = eigs(K_centered, numComponents, 'lm'); % 只取最大特征值对应的特征向量
    eigenvalues = diag(eigenvalues); % 将特征值转换为对角矩阵

    % 归一化特征向量
    for i = 1:numComponents
        eigenvectors(:,i) = eigenvectors(:,i) / sqrt(eigenvalues(i));
    end

    % 将数据投影到新的特征空间
    transformedData = K_centered * eigenvectors;
end

function K = compute_kernel_matrix(X, kernelType, gamma)
    % 计算核矩阵
    n = size(X, 1);
    K = zeros(n);

    switch kernelType
        case 'linear'
            K = X * X';
        case 'poly'
            d = 3; % 多项式核的阶数
            K = (X * X' + 1).^d;
        case 'rbf'
            for i = 1:n
                for j = 1:n
                    diff = X(i,:) - X(j,:);
                    K(i,j) = exp(-gamma * sum(diff.^2));
                end
            end
        otherwise
            error('Unsupported kernel type');
    end
end

代码解释

主函数 kpca_example

• 加载或生成数据集：generate_sample_data 函数生成一个简单的二维数据集，包含两个螺旋形的数据簇。
• 数据可视化：使用 scatter 函数绘制原始数据。
• 设置KPCA参数：选择核函数类型（线性、多项式、RBF），并设置相关参数。
• 执行KPCA：调用 kpca 函数进行核主成分分析。
• 可视化降维后的数据：使用 scatter 函数绘制降维后的数据。

数据生成函数 generate_sample_data

• 生成一个简单的二维数据集，包含两个螺旋形的数据簇，用于演示KPCA的效果。

核主成分分析函数 kpca

• 计算核矩阵：根据选择的核函数类型（线性、多项式、RBF）计算核矩阵。
• 中心化核矩阵：对核矩阵进行中心化处理，使其均值为零。
• 计算特征值和特征向量：使用 eigs 函数计算核矩阵的最大特征值及其对应的特征向量。
• 归一化特征向量：将特征向量归一化。
• 将数据投影到新的特征空间：将原始数据投影到新的特征空间，得到降维后的数据。

核矩阵计算函数 compute_kernel_matrix

• 根据选择的核函数类型（线性、多项式、RBF）计算核矩阵。对于RBF核，需要指定参数 gamma。

注意事项

1. 核函数的选择：不同的核函数适用于不同类型的数据。RBF核通常适用于非线性数据，而线性核适用于线性数据。
2. 参数调整：核函数的参数（如RBF核的 gamma 参数）需要根据具体数据进行调整，以获得最佳效果。
3. 特征选择：在实际应用中，可以根据特征值的大小选择保留的主成分数量，以达到降维的目的。

这个示例代码提供了一个基本框架，你可以根据具体需求进一步优化和扩展。希望这能帮助你理解如何在MATLAB中实现KPCA进行数据降维。