1. 打开MaxQuant界面
2. 如果有之前设置好的参数,可以直接点击“文件”选择“加载参数”导入。没有则跳过。
3. “原始数据”:
“Load”:将.raw文件直接导入软件,根据样本选择“No fractions”或者”Set fractions”。
4. “组特定参数”:
“Modifications”:选择样本相关的修饰,点击“<”添加或删除。
“Instrument”:MaxQuant会自动选择机器类型,也可以手动修改,参数选择软件默认的即可。
5. “全局参数”:
“Add”:导入.fasta文件,点击“Identifier”,选择“Up to first space”。参数根据需要修改。