生信初学者必备的基础知识

如果你是一个生信初学者，又或者你是一个学临床的，为了发文章开始学生信，学了点数据挖掘，GEO，TCGA什么的，但是对很多专有名词不理解，对很多流程或者步骤云里雾里，可以看看这个教程：生物信息学最佳实践-基础篇！

对于很多半路学生信的朋友，或者就是为了发文章而学的人，在初学时都会被庞杂的生物学知识+计算机知识难倒！对于有生物医学背景的来说，计算机知识是最薄弱的地方。

本书则很好的补全了这方面的知识，既然是基础篇，那内容都是生物信息学中最重要的地基部分！学会了这些基础知识，你会发现你的生信数据挖掘豁然开朗，很多不理解的地方都通了。

电脑手机直接访问即可：http://www.biotrainee.com/jmzeng/book/basic/ 。虽然成书于2017年，但是对于初学者来说是很好的学习资料。

下面是一些内容简介

生物信息学的重头戏就是处理各种各样的数据，第1章介绍了生物信息学主流数据产生方法，包括多种多样的芯片技术，二代测序技术和三代测序技术。

既然数据的来源是如此的丰富多样，而且指定标准的单位比较多，就必然会产生各种各样的数据存储形式来规范化交流，第2章会详细介绍fastq,fasta,sam,bam,vcf,gff,gtf,bed,MAF等，理解了它们才能真正的入门生物信息学。

了解了生物信息学领域的常见数据的产生和数据规范还不够，非常高频的需求是跟已有的各种数据库资源做比较，包括与参考基因组比对，基因结构以及功能的注释等等。第3章会详细介绍生信工作者必须了解的主流数据库，包括NCBI,UCSC,ENSEMBL，以及GO,KEGG,GENCODE,SRTINGDB,还有TCGA,ENCODE,1000GENOMES等等。

前3章我觉得是最重要的~

在第4章会罗列一些统计学常识以及高频统计学分析方法。当然，也会推荐一些好的学习资源供大家深入学习提高自己。

第5章主要介绍计算机资源及编程。

第6章是生物学基础。

觉得自己基础知识这一块薄弱的快去学起来~

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