生物信息学算法之Python实现|Rosalind刷题笔记：005 GC含量计算

DNA 序列的 GC 含量是指序列中'G'和'C'所占的百分比。

一条 DNA 序列很容易表示，但是如果有多条 DNA 序列放在一起，则每条序列必须被标记，通常的做法是保存为 FASTA 格式文件。在这种格式中，序列的名称占一行，名称的最前面是一个大于符号‘>’开头，序列名称后面可以跟一系列说明；序列信息从名称的下一行开始，直到遇到下一个以‘>’开头的序列名称为止。Fasta 格式文件可参考下面的示例数据。

给定：一个 Fasta 序列文件。

需得：GC 含量最高的序列名称及其 GC 含量（各占一行行输出）。

示例数据

>Rosalind_6404
CCTGCGGAAGATCGGCACTAGAATAGCCAGAACCGTTTCTCTGAGGCTTCCGGCCTTCCC
TCCCACTAATAATTCTGAGG
>Rosalind_5959
CCATCGGTAGCGCATCCTTAGTCCAATTAAGTCCCTATCCAGGCGCTCCGCCGAAGGTCT
ATATCCATTTGTCAGCAGACACGC
>Rosalind_0808
CCACCCTCGTGGTATGGCTAGGCATTCAGGAACCGGAGAACGCTTCAGACCAGCCCGGAC
TGGGAACCTGCGGGCAGTAGGTGGAAT

示例结果

Rosalind_0808
60.919540

Python 实现

Computing_GC_Content.py