高斯输出文件批量读取能量

最新推荐文章于 2024-12-29 06:44:34 发布

EngzSinger

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分类专栏： Linux 文章标签： linux shell

本文链接：https://blog.csdn.net/EngzSinger/article/details/108113713

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本文介绍了如何利用Linux Shell脚本批量处理高斯量化计算输出文件，快速找到能量值。在多级文件夹中，通过列出所有文件、获取每个文件的最后一个能量值并过滤无关信息，实现高效的数据提取。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

问题背景

在量化计算时，能量是比较重要的概念，而在高斯的输出文件中能量数值往往藏在巨大的文本文件.log中。根据计算任务的大小，.log文件大小也有变化，不过日常计算中获得的文件基本大于十万行，按行查找显然不现实。
Linux的一大好处就是强大的文本文件处理能力，根据计算软件的设定，能量数值出现的行内有特别的标注SCF Done，使用vi打开.log文件，底行模式下输入/SCF Done回车即能瞬间找到目标值。
在这里插入图片描述
vi打开查找的办法还不够简便，因为要重复进行文件打开和关闭的操作，文本查找工具grep便体现出他的价值，无需打开文件就能查找符合条件的文本。

[engzsinger@master TBEP]$ grep "SCF Done" TBEP.log 
 SCF Done:  E(RB3LYP) =  -894.244966606     A.U. after   12 cycles
 SCF Done:  E(RB3LYP) =  -894.263225424     A.U. after   11 cycles
 SCF Done:  E(RB3LYP) =  -894.267963679     A.U. after   10 cycles
 SCF Done:  E(RB3LYP) =  -894.270585213     A.U. after   10 cycles
 SCF Done:  E(RB3LYP) =  -894.273164308     A.U. after   12 cycles
 SCF Done:  E(RB3LYP) =  -894.274338978     A.U. after   10 cycles
 SCF Done:  E(RB3LYP) =  -894.274519626     A.U. after    9 cycles
 SCF Done:  E(RB3LYP) =  -894.274545020     A.U. after    9 cycles
 SCF Done:  E(RB3LYP) =  -894.274550239     A.U. after    9 cycles
 SCF Done:  E(RB3LYP) =  -894.274551722     A.U. after    9 cycles
 SCF Done:  E(RB3LYP) =  -894.274554413     A.U. after    9 cycles
 SCF Done:  E(RB3LYP) =  -894.274556118     A.U. after    9 cycles
 SCF Done:  E(<

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