非因解读 | 利用DSP空间全转录组技术绘制发育中的人类脑部新皮质的细胞结构

新皮质是进化程度较高级的皮质，占据哺乳动物大脑皮质的大部分，与一些高等功能如知觉、运动指令的产生、空间推理、意识及人类语言关联密切。近期，剑桥大学Sanger研究所在bioRxiv杂志在线发表了一篇利用DSP数字空间全转录组（WTA，Whole Transcriptome Atlas）技术来绘制人类胎儿大脑新皮质发育过程中的空间转录图谱，解析发育过程中的细胞通讯、细胞空间结构特征并发现某些疾病相关（如自闭症）基因在大脑深层皮质中的富集（图1）。

非因生物的DSP数字空间全转录组WTA分析服务，可在细胞亚群水平上对组织进行18000+RNA即全转录组分析。DSP实验过程中，需用带有可被紫外光光解的特定识别标签（barcode）的探针孵育到组织上，通过荧光染色（免疫荧光或RNAScope）结果定位待分析细胞亚群，借助仪器精准的紫外光照射，解离并收集Barcode进行扩增、测序、定量，实现细胞亚群水平的空间全转录组定量分析。目前可支持分析的物种有人和小鼠，可分析的样本类别有FFPE、FF、TMA、活检标本、穿刺样本等，支持WTA作为一个多功能的转录组研究工具，用于细胞图谱化和临床样本空间转录组学研究。

图1

背景介绍

人类胎儿大脑新皮质具有显著的空间细胞结构特点，也是随后皮质发育和功能形成的基础。在胎儿皮