非因解读 | DSP空间多组学助力胃癌预后标志物的发现

胃癌作为全球第六大高发癌种，免疫治疗和靶向治疗虽然取得了一定进展，但与其他恶性肿瘤相比，仍缺乏易于操作的临床生物标志物。因此，寻找胃癌预后预测和治疗分层的生物标志物显得尤为重要。而对胃癌尤其是晚期胃癌微环境的研究可能更好地阐明其发病机制，挖掘有临床意义的生物标志物实现病人分层诊疗。

基于Stroma AReactive Invasion Front Areas（SARIFA）的病理形态学研究在结直肠癌的预后分层研究中已经得到了初步共识，其微环境中的肿瘤细胞与间质脂肪细胞的互作也得到了进一步的研究。为了深入研究胃癌组织学预后标志物的意义，2021年10月德国奥格斯堡大学医学院Bruno Märkl团队，主要采用DSP空间组学技术对胃癌TMA样本进行空间转录组检测，并结合免疫组化验证，来挖掘其潜在机制，并在《journal of pathology》杂志（IF=7.996）发表题为“Stroma AReactive Invasion Front Areas (SARIFA) – a new prognostic biomarker in gastric cancer related to tumor-promoting adipocytes”的研究文章（图1）。

图1

研究亮点

研究人员应用胃癌TMA样本，将其分为SARIFA阳性和SARIFA阴性两种亚型。利用DSP技术获得这两种亚型的转录谱数据，并探究与SARIFA