vasp根据电荷密度文件获取z/c轴纵向积分曲线

最新推荐文章于 2025-05-01 19:20:50 发布
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分类专栏： VASP vaspkit 平均电荷密度 文章标签： linux
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1.通过VASP计算处理得到CHGDIFF.vasp文件，将此文件导入VESTA中可以看到其三维分布图

2.同一目录下，例如:CHGDIFF.vasp在./project_name/CHACAR/ 下，那么在当前目录下，运行vaspkit

然后选择1，输入CHGDIFF.vasp差分电荷密度文件


选择3，得到PLANAR_AVERAGE.dat文件，导入到Origin作图即可。

注意：PLANAR_AVEAGE.dat数据中，横坐标是沿着Z轴方向的坐标。

参考：如何绘制平面平均的差分电荷密度图？只需四步！ - 哔哩哔哩 (bilibili.com)

量子化学仿真软件：VASP_（12）.电荷密度与电子结构分析
kkchenjj的博客
12-31 1252
在量子化学仿真软件中，电荷密度和电子结构分析是理解材料性质和化学反应机制的重要工具。通过分析电荷密度和电子结构，可以获取关于电子分布、成键情况、能级结构等关键信息。本节将详细介绍如何在VASP中进行电荷密度和电子结构分析，包括常见的分析方法、输出文件解读以及具体的代码示例。
[VASP learning]计算氧气分子的差分电荷密度、自旋电荷密度、态密度
Dr_Carrot的博客
01-20 2767
用VESTA进行差分电荷密度计算，用vaspkit处理CHGCAR拆分自旋电荷密度，从DOSCAR和PROCAR进行态密度分析。
VASP吸附计算2：CO在Pt（111）面的吸附|VESTA可视化
weixin_50519490的博客
12-19 787
利用VESTA对CHGCAR进行可视化，并绘制差分电荷密度图。
VASP+Multiwfn+VMD绘制静电势图
L1506812723的博客
08-22 1万+
分子周围某一点的静电势通常被定义为将一个单位正电荷从无穷远处移动到这一点所需做的功。简单地讲，如果不考虑其他因素，当分子周围空间某一点静电势为正值时，意味着这一点对正电荷是排斥的；相反，如果某一点静电势为负值时，则意味着这一点对正电荷是吸引的。表面静电势是指在分子周围某个曲面上静电势的分布, 通常我们会使用电子密度的等值面。本文以H2O为例演示根据VASP的输出文件用Multiwfn+VMD绘制静电势图。
VASPKIT绘制平面平均电荷差分密度
weixin_43948934的博客
01-11 7378
平面平均密度差(planar-averaged electron density difference)是密度差的衍生。密度差是个三维空间函数，经常通过绘制平面图、等值面图方式图形化考察。虽然这两种图很直观，但平面图会受到截面选取的影响，而等值面图会受到等值面数值（isovalue）选取的影响，因此都有一定任意性，也不容易定量讨论。对于电子转移有比较明确方向的情况，可以绘制平面平均密度差曲线，由此可以清楚地考察垂直于选取的方向上每个截面上的密度差积分值，在定量讨论、对比上比较便利。
【DFT/DFPT/AIMD】Dalton T.：应变和电场诱导的二维Janus SZrAZ2单层电子性质的改变
m0_72489520的博客
10-31 646
作者从图1（c）中发现， S和A（A=N，P或As）原子呈现明显的电子局域化，峰值在A–Z原子之间。Z=P，As）单层的能带结构，结果如图3所示。作者将Janus SZrAAs2（A=Si，Ge）中的电势差定义为ΔΦ，这归因于S侧和SiAs（GeAs）侧之间的轻微电负性差异，导致SZrAAs2（A=Si，Ge）内的电势差非常小。如图2所示，作者通过对SZrAZ2单层的声子色散谱进行分析，以评估其动力学稳定性，其中SZrSiN2和SZrGeN2单层具有虚频率，而其余四个结构的声子色散谱仅包含正频率。
计算表面静电势_APBS工具
duwenyi2017的博客
12-14 1万+
以下所有内容均属于个人学习过程中的总结，如有错误，欢迎批评指正！ 四川魔德科技有限公司(www.modekeji.cn)，专业从事分子模拟，量子化学等计算服务，欢迎咨询！ APBS工具是一种可以绘制表面静电势的工具，目前在多个软件中均有APBS的插件，如VMD、PyMOL等，但是笔者都使用过这些工具，发现Chimera软件的APBS工具是最方便的，效果图如下所示，适合于初学者，下面我...
vasp中用于电荷密度计算的脚本（chgsum.pl）
10-09
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电荷密度、差分电荷密度.zip资料vasp密度泛函DFT模拟计算态资料文档下载
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电荷密度、差分电荷密度.zip资料vasp密度泛函DFT模拟计算态资料文档下载电荷密度、差分电荷密度.zip资料vasp密度泛函DFT模拟计算态资料文档下载电荷密度、差分电荷密度.zip资料vasp密度泛函DFT模拟计算态资料文档...
Vasp学习经验 #3（电荷密度、态密度、哈密顿布居数）
10-09
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差分电荷密度怎么画_VASP的差分电荷密度计算及图像处理
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VESTA官方手册 | 第六章：设置单相参数
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11-01 1481
当从结构-数据文件中记录的数据不能唯一确定一个设置编号时，VESTA假设在两个原点可选的中心对称空间群中设置编号为2 (一个以原点为反演中心的设置)，在其他所有空间群中设置编号为1。在文本框中需要输入数值的情况下，如果输入的文本不是有效的数值，或者文本框为空，将放弃此次修改。若要显示如图6.17B所示的晶面指数，需选择侧边栏中的Objects选项卡（图 6.18 , a），在页面上半部分的相列表中选择Shape（图 6.18 , b），然后单击标记为“L”（图 6.18 , c）的复选框。
vasp-电荷局域密度图(ELF)
懒散的鱼与消失的猫
07-29 2万+
以Graphene为例： INCAR: 添加LELF = .TRUE. SYSTEM = graphene ISTART = 0 ICHARG = 2 #Startparameter for this run: PREC = A #Electronic Relaxation ENCUT = 500 NELM = 60 NELMIN = 6 NELMDL = -12 EDIFF ..
第一性原理计算软件攻略-利用VESTA绘制差分电荷密度图解
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xk6891的专栏
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1. 软件介绍 VESTA全称为Visualization for electronic and structural analysis. 是一款免费的可视化软件，可以帮助工作者利用第一性原理计算得到的数据制作出赏心悦目的图片。并且VESTA可以运行Materials Studio建模软件中的部分输出文件，通过VESTA和MS（Materials Studio）两款软件，可以完成第一性原理计算中...
差分电荷密度怎么画_科学网差分电荷密度图、电荷局域密度图(ELF)的画
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1) 电荷密度图、差分电荷密度图及ELF的原理2) 计算方法及参数设置影响ELF精确性的参数有哪些？ 在计算效率与精确性/准确性之间衡量。Ecut, KPOINTS?3) 画法及单位问题4) 差分电荷电荷密度图与ELF判别成键情景的各自优毛病5) 软件开发->背后物理化学意义的深刻认识->详细运用(软件开发者，这三方面都做得非常好；其他应用者，应将关器重点放在后面两...
vaspkit使用_Vaspkit做电荷密度差图
weixin_35699301的博客
12-30 5129
原标题：Vaspkit做电荷密度差图 本文版权归作者刘锦程所有，原文链接如下：http://blog.wangruixing.cn/2019/07/12/chgdiff/(点击文末｢阅读原文｣直达原文阅读)Vaspkit 可以方便的处理 VASP 输出的电荷密度文件(CHGCAR)，做电荷密度差分处理，VTST 脚本或者 VESTA 也可以做，但是不如 vaspkit 方便灵活。(注：此文中讲述的...
差分电荷密度怎么画_VASP实用教程从入门到进阶第九弹：差分电荷密度
weixin_39979245的博客
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前面的教程介绍了VASP的输入文件的准备和输出文件的解读，以及建立模型的方法，相信大家通过结合前面的教程并不断地练习一定可以很快的掌握VASP计算的基本技能。接下来我们将通过三章教程来讲解一下电荷方面的计算教程。本章教程先来讲解一下如何计算差分电荷密度。差分电荷密度(charge density difference)通常是用来分析成键的过程或是结构弛豫前后电荷的转移，当然，也有人用来分...
vaspkit使用_VASP 的光学性质计算及 vaspkit 的安装与使用
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使用的软件：VASP, Origin, SshClient, vaspkit.0.51一 光学性质计算在完成结构优化和静态计算后，拷贝 scf 文件夹为 opticcp -rf scf optic编辑 optic 文件夹下 INCARINCARSYSTEM=xISTART=0ENCUT=350EDIFF=1E-5IBRION=-1 # changePOTIM=0.25NSW=0 # changeE...
Linux Shell 重定向与管道符号（＞, ＞＞, |）的实现机制
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imhikaru的专栏
05-01 2018
重定向目标 | 标准输出 → 文件 | 标准输出 → 文件末尾 | 命令输出 → 管道写端，命令输入 ← 管道读端 || 用途 | 输出重定向到文件（覆盖原内容） | 输出追加到文件末尾 | 将前一命令的输出作为后一命令的输入 || 项目 || 系统调用 |
vasp怎么计算电荷密度
03-31
VASP可以通过设置参数来计算电荷密度。具体步骤如下： 1. 在INCAR文件中设置参数LCHARG为TRUE，表示要计算电荷密度。 2. 在KPOINTS文件中设置网格点数目（例如：8 8 8），可以根据具体需要调整网格密度。 3. 运行VASP程序，等待计算完成。 4. 在OUTCAR文件中查找电荷密度输出的相关信息，可以通过搜索关键字“CHGCAR”或者“Total charge density”来查找。 5. 使用可视化软件（如VESTA、VASP Viewer等）打开输出的CHGCAR文件，即可查看电荷密度分布情况。 需要注意的是，电荷密度计算需要较高的计算资源，因此在进行计算时需要注意计算机性能和计算时间。
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