简介:
ggdendro
包和dendextend
包用来画谱系图。
数据聚类
在画图前,首先需要对数据进行聚类。
dist()
距离矩阵
计算距离矩阵。如果base自带不够,可以使用philentropy
包求距离矩阵。
默认计算行之间的距离,如果要求列之间的距离,请先转置矩阵。
返回dist
类对象。
语法:
dist(x, method = "euclidean", diag = FALSE, upper = FALSE, p = 2)
参数解释:
-
x
, 数字类型的矩阵/数据框或dist
对象。 -
method
, 表示计算方法,有:euclidean
, 欧式距离,计算向量中各行之间的距离,数字越小,距离越小。